TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g02820
TIGR annotation:late embryogenesis abundant 3 family protein / LEA3 family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  139.7   16.53
 168.5 
 168 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  111.8   2.88
 116.7  
 116.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  930.4   34.76
 892.1 
 961.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  414.3   9.01
 418.7 
 431.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  122.3   0.25
 122.8 
 122.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  98.7   3.58
 91.5 
 94.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  529.8   22.8
 551.3 
 575.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  137.8   14.92
 110.9 
 113.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  135.1   13.39
 108.3 
 121.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  370.7   5.16
 367.8 
 377.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  838.3   42.74
 849.5 
 917.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  593.5   31.5
 530.6 
 564 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  452.4   15.91
 469.2 
 437.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  209.2   16.03
 195.9 
 227.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  89.5   7.45
 74.9 
 84.6 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  186.6   6.18
 198.1 
 196.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  155.2   21.85
 113.7 
 146.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  117   2.12
 117.7 
 121 
 3.20 Root (ATGE_99)  109.9   3.34
 107.8 
 103.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  175.4   18.44
 150.8 
 139.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  164.1   9.54
 180.3 
 163.5 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  382.6   15.82
 414.2 
 399.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  312.1   15.84
 317.1 
 287.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  451.2   23.17
 434.6 
 405.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  669.8   10.66
 688.2 
 669.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  779.7   24.34
 734.7 
 773.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  546   18.49
 556.4 
 582 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  255.6   9.71
 251.8 
 270.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  194.9   20.96
 182.3 
 223.3 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  150   8.78
 146.3 
 133.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  500.6   22.58
 523.3 
 478.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  637.3   32.48
 698.3 
 687.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  131.7   6.65
 119.8 
 120.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  169   11.19
 147 
 161.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  402.7   19.74
 404.2 
 369.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1173.7   37.04
 1220.4 
 1147.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  92.3   5.06
 98.9 
 102.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  231.1   15.02
 252.8 
 224 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  116.1   3.07
 110.9 
 116.4 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  602.2   35.94
 588.7 
 656.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  268.4   7.35
 277.6 
 282.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1277.8   62.79
 1161.2 
 1179.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  221.6   7.62
 222.4 
 208.8 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1075.7   24.82
 1029.3 
 1037.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  111.3   7.77
 126.8 
 119.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  121.7   7.62
 107.4 
 119.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  259.6   21.2
 283.6 
 301.9 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  206.2   17.32
 176.8 
 207.4 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  159.4   4.53
 168.4 
 164 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  142.3   7.26
 156 
 153.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  190.8   7.22
 204.4 
 193.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1218.2   28.69
 1175.3 
 1229.8 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  553.6   12.48
 567.9 
 543 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  123.3   18.75
 100.6 
 86.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  115.9   4.94
 114.3 
 106.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  139.3   9.95
 132.3 
 119.7 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  132.3   1.33
 134.5 
 134.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  135.6   3.42
 133.4 
 140.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays