TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g08830
TIGR annotation:superoxide dismutase (Cu-Zn) (SODCC) / copper/zinc superoxide dismutase (CSD1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  5231.3   116.64
 5008.5 
 5179.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  8731.6   645.7
 7631.6  
 7595.7 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  4056   157.47
 3751.9 
 3832.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  4666.1   147
 4374.2 
 4489.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  7878.1   403.55
 8657 
 8084.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  8024.1   315.78
 8608 
 8524.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  4902.9   15.68
 4871.9 
 4883.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  3573.4   44.35
 3498.2 
 3576.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  2446.5   6.3
 2456.3 
 2458.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  4474.4   23.09
 4520.5 
 4495.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  3179.7   113.28
 3225.9 
 3010.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2469.3   190.87
 2159.6 
 2507.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2141   181.42
 2128.2 
 1820.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  3805.3   104.61
 3603.3 
 3657 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  10027.4   130.45
 10256 
 10032.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  5417.1   285.99
 5161.7 
 4846.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  1976.9   151.32
 1874.6 
 1679.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  2956.6   121.26
 3073.2 
 3199.1 
 3.20 Root (ATGE_99)  1593.8   22.65
 1621.1 
 1638.7 
 3.20 Roots (ATGE_9)  5124.5   56.66
 5024.3 
 5120.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  10267.6   323.01
 9649.4 
 10120.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  5975.4   236.95
 6330.4 
 6424.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  7492.3   226.54
 7265.7 
 7039.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1082.5   16.6
 1057.1 
 1088.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  6507.9   240.41
 6885.1 
 6954.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  7390.4   160.79
 7322.3 
 7084.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  8231   736.87
 7279.9 
 8730.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  7961.3   68.84
 7823.6 
 7888.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  7202.4   304.85
 7804.4 
 7419.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  7127.9   130.35
 7123.8 
 6900.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1591.1   65.98
 1474.5 
 1586.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1296   68.86
 1187 
 1168.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  10505.7   175.31
 10414.1 
 10753 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  9457.5   16.66
 9465.2 
 9489.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  10553.1   300.47
 10071.1 
 10622.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  4198.7   167.48
 3958.3 
 4280.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  9339.9   210.13
 8973 
 9333.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  7941.6   483.71
 7833.8 
 7055.1 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  8142.9   552.29
 7062.7 
 7802.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  8318.6   280.24
 7854.9 
 7814.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  5596   482.51
 6448.5 
 5630.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  5159.1   427.86
 5485.8 
 4637.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  9941.2   821.88
 8663.8 
 8406.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  6986.7   128.74
 6805.1 
 6737.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  9798.5   281.81
 9700.1 
 9268.7 
 6.00 Flower (ATGE_92)  9798.3   374.95
 9376.5 
 10124.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1644.3   314.99
 1066.3 
 1138.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  5758.9   448.68
 6656.1 
 6219.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  5324.2   168.77
 5183.9 
 4988.2 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  7775   316.95
 7474.4 
 7141.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  10002   74.96
 10061 
 9912.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  3215.9   121.8
 3089.1 
 3332.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2263.1   33
 2301.1 
 2235.3 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2745.4   102.9
 2850.9 
 2951.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2848.7   28.38
 2859.3 
 2805.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1859.6   7.95
 1874.1 
 1861.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1687.5   34.08
 1754.6 
 1731.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1582.8   2.94
 1577 
 1580.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays