TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g10090
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  370.1   8.56
 353.5 
 365.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  413.1   23.41
 459.8  
 439.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  453.2   8.54
 436.1 
 445.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  341.8   6.65
 348.4 
 335.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  297.7   11.38
 281.2 
 303.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  244   5.88
 254 
 243.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  318.9   23.57
 287 
 272.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  552   37.93
 527.7 
 477.6 
 1.03 Root (ATGE_95)  439   20.71
 473.3 
 476.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  263.4   9.5
 271.5 
 282.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  401.8   27.86
 410.4 
 453.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  349.2   20.13
 389.5 
 368.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  302.5   8.39
 305.7 
 318.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  293.6   8.71
 306.9 
 310 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  218.7   7.05
 208.5 
 205.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  289   10.05
 303.6 
 308.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  415.5   14.77
 391.6 
 418.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  485.3   13.45
 464 
 460.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  384.5   9.21
 394.9 
 402.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  300.4   9.4
 319.2 
 308.5 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  613.7   30.43
 552.9 
 582.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  667   34.78
 631.9 
 597.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  536.6   23.81
 539.9 
 497.1 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  358.3   6.24
 369.6 
 368.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  532.1   32.77
 500.6 
 466.5 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  604.5   39.21
 527.7 
 579.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  489.1   17.66
 523.4 
 513.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  456.6   29.4
 462.8 
 510.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  412.6   18.04
 380.5 
 382.3 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  300.9   24.97
 327.3 
 350.8 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  394.5   12.49
 404.4 
 379.6 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  382   9.22
 365.8 
 381.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  193.8   6.38
 195.6 
 183.7 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  191   15.65
 160 
 172 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  227.1   17.52
 242.4 
 207.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  386.6   19.58
 422.2 
 390.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  354.2   2.91
 350.2 
 355.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  498.2   9.92
 508.3 
 488.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  165.1   3.69
 157.7 
 161 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  441.3   36.6
 377.1 
 378.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  344.3   28.8
 357.8 
 399.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  436.3   14.63
 433 
 409.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  903.5   22.59
 877.7 
 858.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  541.6   16.72
 510.4 
 515.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  231.2   5.48
 236.4 
 225.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  215.2   3.51
 208.4 
 213.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1001.6   163.38
 1326.5 
 1133.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  435.2   31.46
 495.9 
 451 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  552.3   3.09
 550.7 
 556.7 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  365.3   14.52
 372.2 
 393.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  515   12.75
 502.6 
 528.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  467.6   23.45
 429.3 
 425 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  480.3   4.07
 474.1 
 472.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  256.6   14.27
 230 
 252.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  246.7   10.14
 264.9 
 263.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  250.2   4.82
 241.2 
 242.8 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  232.7   14.08
 221.6 
 204.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  249.1   13.81
 248.7 
 225 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays