TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g11360
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  891.9   3.42
 887.3 
 885.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  744.3   19.79
 705.2  
 729.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  573.4   14.48
 593.4 
 601.6 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  608   18.41
 572 
 596.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  641.8   15.57
 635.7 
 665.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  732   10.11
 714.2 
 714.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  359   11.46
 374.2 
 381.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  858.9   43.7
 815.8 
 903.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  784.5   12.49
 765.3 
 788.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  527.9   13.98
 551.7 
 527 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  439.2   30.77
 498.5 
 483.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  786.5   22.79
 826.8 
 825.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  721.4   16.66
 689 
 711.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  541.8   18.46
 578.1 
 565.6 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  779.7   25.53
 787.3 
 739.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  589.6   20.3
 579.7 
 618.7 
 3.20 Root (ATGE_93)  793.5   18.35
 759.4 
 764.8 
 3.20 Root (ATGE_98)  945.8   12.66
 925 
 922.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  789.1   12.44
 772.4 
 764.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  960   22.85
 923.1 
 918.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  701.3   9.75
 710.9 
 720.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  595.8   32.46
 598.9 
 541.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  567.7   21.86
 556.4 
 598.6 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  711.2   5.01
 701.3 
 707.5 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  616.6   27.22
 632.3 
 669.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  632.3   29.9
 573.4 
 611.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  519.7   10.96
 540.9 
 525.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  507   5.78
 502.8 
 514.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  567.8   35.6
 502.4 
 510.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  547.4   10.22
 534.4 
 527.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  823.3   18.29
 821.1 
 853.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  896.8   19.63
 922.4 
 883.9 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  783.6   21.42
 764 
 740.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  651.5   33.24
 695.6 
 630.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  634.1   49.87
 694.8 
 595.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  444   19.3
 453.9 
 416.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  803.2   14.24
 776.8 
 780.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  555.4   18.96
 560.1 
 525.1 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  729   26.37
 728.6 
 683.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  614   35.93
 630.6 
 561.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  678.4   30.85
 734.2 
 729.1 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  468.9   28.25
 482.1 
 427.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  742.8   24.84
 707.8 
 694.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  668.2   2.9
 671 
 674 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  732   26.26
 731 
 686.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  786   20.66
 758.7 
 799.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  354   24.25
 337.4 
 306.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  531.4   31.62
 476.5 
 531.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  720.6   10.03
 701 
 707.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  701   17.01
 679.2 
 712.7 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1064.4   40.18
 1085.9 
 1008.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  687.2   43.72
 768.9 
 701 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  814.6   15.11
 839.4 
 841.9 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  853.1   42.62
 932.4 
 919.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  867.7   18.59
 902.2 
 872.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1352.5   47.91
 1342.7 
 1430.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1399.6   122.35
 1574.1 
 1635.4 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1874.8   184.73
 1578.6 
 1535.4 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays