TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g27760
TIGR annotation:interferon-related developmental regulator family protein / IFRD protein family
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  640.9   9.23
 652 
 633.7 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  577   25.34
 593.6  
 626.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  463.8   8.42
 465.6 
 479.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  314.4   24.23
 277 
 269 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  497.4   32.54
 438 
 490.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  558.3   18.95
 583 
 595.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  704   10.49
 683.5 
 697.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  946.7   59.86
 840.8 
 845.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  957.3   50.94
 956.9 
 1045.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  467   12.86
 489.4 
 489.1 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  613.1   24.86
 643.1 
 662.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  577.2   28.85
 531.6 
 585 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  764.6   17.32
 731.1 
 755.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  523.3   45.17
 599.2 
 518.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  739.9   17.42
 772.7 
 746.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  470.1   16.6
 483.2 
 503 
 3.20 Root (ATGE_93)  836.1   33.9
 888.6 
 825.2 
 3.20 Root (ATGE_98)  890.3   29.97
 945.5 
 897.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  1131.2   26.45
 1130.3 
 1176.6 
 3.20 Roots (ATGE_9)  495.8   19.72
 461.2 
 462.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  248.7   34.33
 308.6 
 307.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  432.1   43.07
 471 
 385 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  353   12.87
 340.2 
 327.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  421.9   22.21
 463.2 
 456.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  618.7   1.4
 616.2 
 616.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  540.4   21.85
 497.6 
 526.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  387.9   19.06
 425.1 
 413.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  346.2   11.51
 350.5 
 367.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  318.1   8.38
 315.3 
 331 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  298   21.16
 329.2 
 288.9 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  536.9   15.85
 515.9 
 505.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  770.4   28.22
 747.5 
 714.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  832.9   32.35
 893.5 
 843.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  912   75.5
 1054.9 
 941.1 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  891.5   23.19
 854.1 
 896.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1502.4   21.66
 1487.8 
 1459.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  624.3   32.42
 633.8 
 573.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1412.7   7.44
 1427.3 
 1417.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  537.4   7.37
 528.2 
 542.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1163   32.02
 1152.8 
 1212.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  388.5   50.6
 462.6 
 365.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2861.5   239.13
 3091.5 
 3339.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1216.3   49.2
 1122.8 
 1196.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1209.4   27.04
 1220.1 
 1168.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  579.1   7.19
 565.5 
 568.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  866.2   28.98
 891 
 833.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  710.7   65.04
 603.7 
 593.1 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  738.1   28.93
 783.8 
 791.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2065.4   202.25
 1751.1 
 1687.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  720.9   22.42
 708.4 
 751.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  568.3   58.36
 597.9 
 485.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1207.3   55.12
 1309.5 
 1294.2 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  985.3   30.46
 1044.4 
 1027.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  886.5   57.03
 931.4 
 999.7 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1163   4.25
 1170.5 
 1170.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1361.8   69.83
 1445 
 1306.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1840.6   51.36
 1803.8 
 1739.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1434.4   16.24
 1433.2 
 1461.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays