TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g35670
TIGR annotation:calcium-dependent protein kinase 2 (CDPK2)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  593.8   33.16
 537.6 
 535.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  308.3   8.94
 297.5  
 315.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  490.7   2.99
 486.1 
 485.1 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  530.8   52.47
 426.3 
 487 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  377.3   13.7
 374.5 
 352.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  331.8   21.87
 313.7 
 288.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  345.1   21.1
 335.2 
 304.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  862.5   13.82
 867 
 841.1 
 1.03 Root (ATGE_95)  822.4   24.64
 861.7 
 867.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  393.3   25.39
 443.9 
 421.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  324.6   4.52
 330.3 
 321.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1106.4   38.18
 1111.8 
 1043.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  418.3   12.68
 427.4 
 402.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  345.8   57.6
 443.2 
 341.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  262.9   23.42
 230.8 
 276.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  367   10.45
 379.6 
 358.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  834.2   19.24
 860 
 822.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  757.9   15.97
 745 
 726.1 
 3.20 Root (ATGE_99)  695.6   7.98
 708.2 
 693.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  478.6   12.32
 458.8 
 456 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  383   27.92
 438.3 
 417.5 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  557.3   23.03
 567.2 
 601.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  463.6   20.43
 503.9 
 478.1 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  338.4   15.81
 355.1 
 370 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  736.4   51.42
 657.5 
 754.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  560.8   26.67
 614.1 
 589.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  525.2   14.47
 523.8 
 549.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  410.9   12.48
 406.2 
 429.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  379.7   13.16
 353.8 
 370.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  334.8   13.49
 360 
 339.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  838.7   49.22
 756.8 
 750.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  456.9   39.05
 423.1 
 379.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  356   30.01
 302.2 
 352.2 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  259.5   32.59
 315.7 
 259.1 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  380   29.61
 338.6 
 396 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  384.9   22.38
 407.7 
 363 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  225.4   3.69
 220.9 
 218.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1181.1   36.73
 1127.9 
 1198.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  231.4   12.38
 237.2 
 255.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  258.9   5.84
 269.5 
 268.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  310.2   36.07
 372.7 
 310.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  399.2   22.61
 431.9 
 442.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  242.9   7.13
 228.8 
 237.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  530.1   17.86
 494.4 
 513.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  231   3.72
 233.2 
 238.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  336   8.54
 319.5 
 331.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1548.4   65.95
 1517.2 
 1421.8 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  475.2   29.31
 530.8 
 487 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  366.7   24.12
 346.5 
 394.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  328.9   19.14
 342 
 366.6 
 6.50 Stem (ATGE_27)  440.9   21.5
 420.4 
 398 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  311.3   18.57
 340.7 
 345.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  357   3.54
 364.1 
 360.3 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  395.7   4.76
 403.8 
 395.4 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  361   29.69
 412.3 
 412.5 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  245.8   20.76
 284.4 
 278.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  251.4   7.6
 257.2 
 242.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  231.3   12.47
 226.3 
 207.6 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays