TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g47128
TIGR annotation:cysteine proteinase (RD21A) / thiol protease
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1628.6   49.22
 1696.5 
 1724.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  2922.8   84.03
 2828.4  
 2755.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  4753.8   231.45
 4478.9 
 4293.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  2259.6   45.77
 2193.5 
 2171.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1770.1   35.52
 1769.8 
 1831.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1456.9   16.28
 1477.3 
 1489.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  2458.4   25.23
 2501.3 
 2502.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  4002.9   182.34
 4258.5 
 4356 
 1.03 Root (ATGE_95)  4580.8   328.32
 5012.8 
 4368.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1815.8   9.2
 1816.3 
 1800.1 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  2538.2   97.42
 2732.9 
 2642.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  4046.4   124.25
 3985.5 
 3807.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  4049.9   109.57
 4240.9 
 4238.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  2250.7   69.67
 2305.7 
 2167.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1038.4   22.56
 1083.5 
 1058.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  2138.9   150.08
 1839.7 
 1968.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  4369   272.06
 4869.5 
 4804 
 3.20 Root (ATGE_98)  5225.9   263.26
 5232.2 
 5685 
 3.20 Root (ATGE_99)  6589   277.64
 6557.8 
 6093.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1518.2   27.64
 1507.5 
 1465.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  2350.6   35.36
 2280.3 
 2308.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  3396.4   80.16
 3239.8 
 3288.5 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  3102.6   127.9
 2846.9 
 2980.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  3474.7   26.14
 3485 
 3435.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  6259.9   61.38
 6332.7 
 6381.9 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  4567.4   54.92
 4665.4 
 4659.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  3910   101.54
 3722.7 
 3884.2 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2957.1   36.23
 2945.1 
 3013 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  2536.8   8.12
 2552.6 
 2541.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  2382.2   85.66
 2328.6 
 2214.5 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  5205.1   55.44
 5100.1 
 5183.4 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  6358.5   351.49
 5671 
 6141.9 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1982.6   4.52
 1991 
 1983.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  3129.3   168.56
 2918.1 
 3251.3 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  3419   300.71
 3797.2 
 4013.1 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  7043.1   531.83
 6607.1 
 7665.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2456.2   64.82
 2540.4 
 2412.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  7646   108.03
 7622.6 
 7820.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1505   52.76
 1553.4 
 1610.4 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  8758.8   228.99
 9211.8 
 9043.4 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  2855.6   112.26
 3038.9 
 2835 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  12898.5   449.94
 12835.3 
 12089.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  12607.2   521.39
 11570.5 
 12186.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  10348.7   307.11
 9735.4 
 10071.1 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  3612.8   375.58
 2875.3 
 3367.7 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2551   32.44
 2515.8 
 2580.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  323   21.1
 326.9 
 361.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  7430.9   281.7
 7892.7 
 7941.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  11904.3   74.15
 11796 
 11937.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  3548   98.1
 3356 
 3417.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  5647   201.45
 5328.6 
 5701.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  4756.4   85.47
 4609.8 
 4606.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  5213.5   311.88
 4823.3 
 4597 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1076   40.23
 996.6 
 1025.3 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1877.5   185.16
 1871 
 1553.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  2811.8   105.35
 2830.6 
 2639.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  3124.4   80.68
 2997.4 
 2974.8 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  3144.1   58.06
 3134.3 
 3039 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays