TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g48960
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  325.5   7.9
 340.8 
 336.7 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  278.2   12.86
 301.3  
 299.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  562.6   39.83
 511.1 
 484.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  300.3   14.92
 329.1 
 321.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  296.6   15.01
 326.6 
 312 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  262.9   10.01
 265.8 
 281.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  247.8   18.08
 283.6 
 270 
 1.03 Root (ATGE_94)  339.4   12.86
 325.5 
 351.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  358.6   29.3
 404.8 
 413 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  283   8.34
 297.1 
 282.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  273   7.39
 275.2 
 261.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  406.8   10.59
 390.7 
 386.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  437.2   16.59
 436 
 407.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  254.7   10.26
 241 
 234.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  253.4   26.34
 229.6 
 282.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  262.1   19.83
 267.8 
 299 
 3.20 Root (ATGE_93)  420.5   4.73
 429 
 428.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  318.7   22.63
 363.6 
 336.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  355.7   10.44
 347.6 
 368.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  362   25.67
 312.7 
 349.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  344.8   9.39
 332.6 
 351 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  406.5   15.29
 428.9 
 399.6 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  385.1   16.05
 397.3 
 365.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  297.4   8.1
 309.2 
 293.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  486.2   30.89
 496.6 
 544.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  459   15.46
 489.4 
 469.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  430.9   20.55
 457.2 
 471.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  391.3   10.31
 373.2 
 373.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  322   8.46
 338.5 
 327.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  308.4   8.08
 296.8 
 292.9 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  404.5   4.12
 403.1 
 396.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  342.2   5.46
 347.5 
 336.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  315   1.24
 313.7 
 316.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  236.1   17.12
 217.4 
 201.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  247.9   8.79
 231.7 
 245.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  280   11.47
 259.6 
 278.9 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  212.7   18.36
 231.9 
 249.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  261.7   20.23
 300 
 269.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  245.8   8
 243.6 
 258.4 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  236   4.1
 236.9 
 243.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  325.9   6.73
 337.1 
 338 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  271.4   3.31
 274.8 
 268.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  275.8   19.7
 287.8 
 249.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  282.2   8.57
 277.1 
 293.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  234.1   10.89
 252.4 
 233.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  232.3   12.79
 212.7 
 236.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  322   8.46
 311.7 
 328.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  468.6   8.04
 484.7 
 476.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  342.1   1.14
 339.9 
 340.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  292.6   16.53
 265.8 
 262.5 
 6.50 Stem (ATGE_27)  422.8   7.89
 436.6 
 423.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  312.2   25.72
 335.6 
 363.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  320.8   12.1
 301.9 
 324.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  364.6   7.92
 357.7 
 373.5 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  391   19.69
 429.4 
 403 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  456.2   22.31
 411.6 
 436.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  377.9   8.93
 383.4 
 365.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  429.4   13.7
 402 
 414.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays