TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g52000
TIGR annotation:jacalin lectin family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  37   1.55
 35.2 
 38.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  725.8   42.72
 809.1  
 751 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  780.5   53.84
 678.1 
 700.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  249.6   36.69
 180.1 
 194.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  427.5   22.09
 414.4 
 457.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  584.3   22.22
 555.6 
 540.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  706.8   35.94
 635.5 
 663 
 1.03 Root (ATGE_94)  48.9   4.04
 41.4 
 42.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  43.9   3.4
 37.9 
 38.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  154.4   8.6
 170.7 
 167.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1664.9   72.72
 1565.2 
 1523.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  345.3   14.53
 335.4 
 364 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  384.7   9.54
 389.6 
 403.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  2403.3   120.9
 2426.4 
 2206.4 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1095.7   62.23
 1128.7 
 1008.3 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  2322.7   212.92
 1961 
 1947.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  41.5   4.5
 42.8 
 49.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  48.7   4.49
 41.8 
 50.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  44.3   4.85
 52.3 
 43.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  40.7   2.56
 35.7 
 37.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  683.7   54.99
 709.5 
 604 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  606.4   28.38
 653.8 
 603.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  360.1   30.95
 409.8 
 416.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  507.7   25.86
 463 
 507.9 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2547.1   481.19
 2514.8 
 1698 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1085.5   72.99
 1091.4 
 962.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  542.6   47.28
 578.9 
 485.1 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  399   16.03
 367.3 
 387.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  314.4   27.37
 259.8 
 284.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  364.7   15.7
 344.2 
 375 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  854   25.51
 892.3 
 844 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  956.5   85.48
 1048.2 
 877.4 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  789.9   34.47
 785.7 
 847.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  639.3   64.5
 766.9 
 686.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  734.2   65.8
 610.2 
 710.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  353.6   11.04
 357.4 
 336.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  781.8   40.47
 815.3 
 734.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  363.2   28.46
 312.4 
 315.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  793.2   24.44
 763.5 
 744.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  772.1   27.73
 794.1 
 739 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  491.2   21.01
 452.4 
 457.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  436   36.82
 383.2 
 365.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  742.2   79.22
 611.9 
 755.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  776.1   51.32
 722.9 
 673.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  585.7   37.05
 602 
 531.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  710.8   75.24
 686.3 
 570 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  45.9   8
 35.8 
 51.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  266.5   14.16
 243.1 
 241 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1354.7   75.57
 1296.6 
 1446.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  132.4   12.85
 147.1 
 158 
 6.50 Stem (ATGE_27)  189.9   15.77
 172.4 
 158.4 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  18.6   7.95
 33.8 
 30.2 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  24.9   7.01
 27.5 
 38.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  23.9   2.28
 28.3 
 27.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  28.1   85.94
 24.5 
 175.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  22.4   2.05
 20.9 
 24.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  25.6   1.77
 28.3 
 28.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  30.4   4.08
 22.3 
 25.4 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays