TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g52200
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1287.2   34.57
 1229.2 
 1290.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  273   27.12
 325.6  
 287.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  832.7   18.73
 856.3 
 869.6 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  125.1   10.02
 139.1 
 119.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  73.4   3.57
 80.5 
 76.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  66   3.59
 63.2 
 70.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  69.9   7.06
 72 
 83 
 1.03 Root (ATGE_94)  2994.3   167.78
 3181.1 
 2846.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  2113.5   107.98
 2244.9 
 2327.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  91.6   3.66
 97.3 
 90.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  112.9   4.36
 117.6 
 121.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  5161.7   56.03
 5273.7 
 5220.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2914.4   75.94
 3060.9 
 3022.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  111.6   3.16
 105.4 
 107.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  64.6   1.34
 63.4 
 61.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  121.1   5.9
 130.8 
 131.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  1870.2   10.77
 1883.1 
 1891.6 
 3.20 Root (ATGE_98)  3212.9   57.76
 3108.3 
 3118 
 3.20 Root (ATGE_99)  1910.7   47.06
 1817.7 
 1851.9 
 3.20 Roots (ATGE_9)  941.6   39.64
 908.2 
 862.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  177.7   4.24
 171.6 
 179.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  614.5   28.55
 665.7 
 618.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  485   27.07
 497.9 
 445.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  390.9   2.3
 395.2 
 391.5 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1192.8   38.85
 1228.8 
 1151.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  726   22.19
 692 
 733.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  383.5   20.55
 414 
 422.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  247.3   21.44
 252.8 
 286.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  259.9   12.31
 241 
 236.8 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  138.3   10.63
 135.5 
 155.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1401.2   34.52
 1470 
 1431.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  676   39.37
 696.6 
 752.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  50.8   2.66
 53.5 
 56.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  69.3   9.54
 50.9 
 55.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  112   6.57
 122.5 
 110.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  297.1   11.55
 318.1 
 299.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  64.1   1.88
 60.9 
 64.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  58.4   9.6
 77.6 
 67.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  58.7   1.07
 58 
 60.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  441.2   29.49
 387.8 
 392.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  68.3   3.26
 69.5 
 74.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1310.1   43.42
 1293.6 
 1375.7 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  112.4   4.15
 119.8 
 119.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  107.9   6.15
 116.8 
 119.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  57.7   2.57
 62.2 
 57.8 
 6.00 Flower (ATGE_92)  69.5   2.36
 65.4 
 69.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  116.6   7.96
 119.2 
 104.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  657   35.75
 687.3 
 616.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  867.5   47.68
 947.9 
 863.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  68.1   4.67
 76.5 
 68.7 
 6.50 Stem (ATGE_27)  219.9   15.72
 192.9 
 220.4 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  66.7   2.82
 70.3 
 72.2 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  84.4   1.07
 84.9 
 86.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  75.5   4.47
 66.7 
 69.5 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  73.1   4.65
 67.2 
 63.9 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  72.1   8.58
 55.4 
 67.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  97.6   2.21
 93.7 
 97.4 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  84.6   9.51
 67.4 
 82.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays