TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g55870
TIGR annotation:CAF1 family ribonuclease
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  176.9   6.19
 181.9 
 189.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  144.1   7.49
 158.4  
 147.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  127.3   6.77
 114.5 
 124.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  120.9   6.09
 133.1 
 127 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  159.3   4.56
 150.8 
 158 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  197.2   5.23
 188.1 
 197.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  210.6   8.65
 195.1 
 196.2 
 1.03 Root (ATGE_94)  159.4   4.55
 151.6 
 151.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  162.2   6.13
 162.1 
 172.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  147.2   12.03
 145.1 
 166.9 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  157.5   1.71
 159.8 
 160.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  128.3   6.41
 116.4 
 118.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  118.5   5.97
 119.9 
 129.5 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  163.4   8.02
 179.4 
 169.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  196.7   13.02
 222 
 214.7 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  162.1   10.18
 179.7 
 179.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  144.4   10.68
 148.3 
 128.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  152.9   8.02
 167.7 
 165.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  159.2   11.27
 173.6 
 151.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  144.2   9.84
 144.3 
 161.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  114.6   3.46
 121.5 
 118.3 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  121.3   8.43
 105.3 
 108.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  103.9   14.86
 124.5 
 95.6 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  120.9   5.36
 113.3 
 123.7 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  120.3   7.65
 134.3 
 122 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  103.8   5.55
 99.7 
 110.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  113.5   13.13
 122.4 
 139.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  122.8   4.78
 113.3 
 117.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  127.2   7.87
 129.5 
 114.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  121.6   1.96
 120.2 
 124.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  116.5   2.19
 112.2 
 114.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  121.6   4.33
 119.2 
 113.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  153.3   13.41
 180 
 164.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  161.2   3.46
 168 
 163.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  145.4   7.44
 131.1 
 141.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  132   7.64
 123 
 138.2 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  109.4   2.93
 109.3 
 114.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  111.8   2.65
 117 
 113.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  174.8   9.54
 156.4 
 170 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  147.5   5.01
 141.1 
 137.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  111.3   6.2
 122.9 
 120.7 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  145.6   8.19
 151.1 
 161.7 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  141.9   6.72
 131.4 
 129.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  106.5   3.44
 112.6 
 112.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  178.1   3.75
 170.8 
 173.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  144.6   10.17
 159.9 
 163.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  104   31.64
 101.3 
 157.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  138.7   5.99
 138.5 
 128.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  185.5   11.13
 174.8 
 163.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  99.7   5.96
 111.2 
 108.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  128.2   4.06
 122.6 
 130.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  158.2   15.33
 127.9 
 138.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  156.8   7.82
 157 
 143.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  149   6.67
 152.4 
 161.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  187.5   5.78
 175.9 
 180.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  258.2   11.67
 265.1 
 281 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  324   15.56
 326.3 
 352 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  323   1.8
 320.1 
 323.4 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays