TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At1g56010
TIGR annotation:transcription activator NAC1 (NAC1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  505.4   41.35
 430.7 
 437.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  428.5   21.41
 417.7  
 387.2 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  228.5   9.75
 221.9 
 241.1 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  83.1   6.26
 93 
 94.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  78.3   5.31
 87.9 
 79.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  77.7   4.14
 71.5 
 79.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  86.6   6.09
 96.5 
 97.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  616.6   61.6
 680.8 
 739.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  739   26.33
 761.8 
 709.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  90   3.16
 83.8 
 87.5 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  128.3   3.8
 121.2 
 122.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  190.6   7.94
 176.2 
 177.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  254.9   6.66
 263.4 
 250.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  127.2   16.5
 95.7 
 120 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  64.6   3.45
 64.5 
 70.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  118.6   5.48
 116.5 
 108.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  686.5   8.11
 699.2 
 684.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  1073.4   52.02
 1110.7 
 1007.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  1085.5   35.15
 1018.4 
 1070.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  377.3   15.16
 392.1 
 407.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  184   7.11
 176.5 
 169.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  163.1   10.37
 154.7 
 175.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  142.6   5.19
 132.2 
 137.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  169.3   3.96
 163.2 
 161.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  478.1   24.58
 499.7 
 450.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  292.5   6
 294.5 
 303.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  208.8   17.15
 193.8 
 174.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  142   2.43
 143.4 
 138.7 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  95.8   2.95
 91.8 
 90 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  78.3   7.88
 76.3 
 90.9 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  267.2   9.32
 250.5 
 265.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  217.4   19.87
 246.3 
 255.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  82.6   6.54
 73.3 
 70 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  86.7   11.69
 64.2 
 80.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  86.2   9.58
 84.9 
 69 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  80   2.66
 79.8 
 75.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  80.5   9.66
 82.5 
 98.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  115.7   11.48
 138.3 
 130.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  88.7   4.14
 91.8 
 83.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  375.1   14.79
 400.6 
 374.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  88.4   3.74
 82.3 
 89 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  230.9   6.3
 240.4 
 228.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  979.2   59.02
 1051.6 
 934.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  587.6   0.98
 585.7 
 586.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  105.6   7.92
 90 
 99.7 
 6.00 Flower (ATGE_92)  83.3   7.7
 68 
 77 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  275.8   21.77
 298 
 319.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  290.4   24.09
 281.1 
 326.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1100.7   20.72
 1126.1 
 1085 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  123.7   4.12
 131.9 
 127.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  355.1   28.92
 298.9 
 338.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  275.3   2.66
 280.4 
 276.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  257.3   8.79
 263.7 
 246.3 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  150.9   4.15
 143.7 
 150.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  142.6   4.61
 135.2 
 143.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  174.3   16.06
 147.4 
 145.5 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  178.7   9.15
 161.4 
 164.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  167.6   3.33
 171.4 
 164.7 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays