TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At1g56570
TIGR annotation:pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  88.4   5.13
 83.1 
 78.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  85.7   3.32
 80.7  
 79.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  84.5   3.61
 87.5 
 80.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  112   8.74
 104.3 
 121.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  109.3   3.13
 115.4 
 111.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  105.6   12.68
 124.3 
 129.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  122.3   6.84
 108.8 
 113.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  80.5   7.69
 69.8 
 65.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  62.8   6.95
 72.9 
 59.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  121.2   6.87
 112.3 
 107.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  86   4.9
 95.8 
 90.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  73.6   3.59
 72.7 
 79.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  86   5.87
 74.4 
 78.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  94.7   16.39
 122.9 
 94.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  123.1   5.84
 114.3 
 125.3 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  100.3   3.19
 98.7 
 104.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  75   3.48
 80.5 
 74 
 3.20 Root (ATGE_98)  75.4   4.04
 67.4 
 70.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  76.4   3.27
 71.8 
 70.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  77.7   1.88
 81.4 
 80.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  89.5   0.87
 91.2 
 90.5 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  87.9   2.61
 89 
 92.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  85.8   4.34
 94 
 92.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  107.7   6.61
 95.1 
 98.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  79.3   1.34
 81.9 
 80.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  85   11.68
 96.6 
 73.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  87.4   2.9
 89.3 
 93.1 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  75.1   4.01
 83 
 80 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  81.4   8.54
 96.8 
 82.7 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  96.5   3.07
 96.6 
 91.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  85.8   2.33
 81.8 
 81.6 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  82.2   2.73
 82.6 
 77.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  96.5   2.54
 93 
 91.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  77.4   10.35
 97.9 
 85.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  85.7   4.24
 77.2 
 81.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  67.4   7.41
 82.1 
 72.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  79.3   1.19
 79.2 
 77.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  60.9   6.78
 62.8 
 73.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  90.1   5.97
 84.2 
 96.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  84.4   3.51
 79.7 
 77.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  74   15.56
 103.1 
 78.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  84.9   4.94
 75.1 
 79.4 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  72.2   1.03
 70.9 
 70.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  68.4   7.4
 83.2 
 75.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  82.7   3.08
 88 
 82.7 
 6.00 Flower (ATGE_92)  81.7   3.35
 88.4 
 84.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  111.6   8.48
 126.8 
 112.7 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  69.9   2.56
 74.9 
 73.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  81.7   2.51
 78.6 
 83.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  71   2.67
 71.2 
 75.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  62.9   4.53
 71.4 
 69.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  71.7   1.86
 73.7 
 75.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  59.1   3.29
 58.9 
 64.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  61.3   4.47
 68 
 69.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  66.3   3.83
 73.4 
 67.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  59   18.9
 83.3 
 96.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  75.8   8.21
 89.1 
 90.8 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  99.3   12.53
 74.7 
 83 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays