TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g57870
TIGR annotation:shaggy-related protein kinase kappa, putative / ASK-kappa, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  351.5   6.71
 351.3 
 339.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  412.9   7.5
 425  
 426.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  500.3   27.67
 516.3 
 462.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  384.7   7.15
 372.9 
 371.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  319.6   4.74
 320 
 328 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  303   15.12
 331.8 
 309.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  377.1   7.34
 383.4 
 368.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  351.7   9.46
 361.9 
 370.6 
 1.03 Root (ATGE_95)  356.5   16.97
 382.9 
 388.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  342.7   1.56
 339.9 
 342.6 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  366   12.87
 341.6 
 361 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  346   11.03
 332.5 
 324.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  355.2   5.87
 353.6 
 344.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  337   6.56
 340 
 327.4 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  305.2   3.14
 307.9 
 311.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  330.7   24.99
 342 
 294.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  396.7   19.52
 386.8 
 359 
 3.20 Root (ATGE_98)  291.7   23.14
 329.8 
 333.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  325.9   10.61
 344.4 
 326.2 
 3.20 Roots (ATGE_9)  304.5   12.86
 327.1 
 326.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  412.4   11.88
 397.1 
 389 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  436.1   13.38
 418.9 
 445.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  433.4   11.5
 416.1 
 411.6 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  439.5   3.47
 441.3 
 446.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  502   7.86
 507.6 
 492.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  469.3   17.42
 483.4 
 504 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  457.5   16.33
 445.7 
 478 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  424.4   3.16
 430.4 
 429 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  362.6   4.87
 363.8 
 371.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  353.2   10.04
 363.3 
 373.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  367.5   4.96
 376 
 376.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  392.3   19.34
 365.3 
 354.9 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  355.4   7.23
 365.8 
 369.2 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  396.6   5.89
 405.2 
 393.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  406.3   14.59
 400.2 
 378.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  482   16.4
 450.1 
 459.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  455.2   12.29
 474.4 
 478.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  424.8   11.45
 434.3 
 411.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  387   4.66
 391.9 
 382.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  460.8   11.74
 468.3 
 483.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  411   8.97
 427.3 
 412.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  499.9   16.94
 525.8 
 493.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  670.1   9.56
 671.5 
 687.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  602.5   8.02
 604.6 
 617.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  403.5   3.34
 402 
 397.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  334.5   20.83
 375.5 
 361.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  242.1   26.32
 237.2 
 285 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  551.4   29.98
 582.3 
 611.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  571.2   7.41
 565.8 
 556.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  408.5   11.14
 430.5 
 422.6 
 6.50 Stem (ATGE_27)  904.1   4.57
 895.3 
 901.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  496.3   5.39
 505.2 
 495.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  448.1   16.2
 455.5 
 479.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  446.1   8.26
 437.8 
 454.3 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  473.8   9.44
 470.4 
 456 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  450.2   19.97
 431.8 
 410.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  425.4   4.76
 433.6 
 433.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  394.5   22.68
 438.6 
 407.5 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays