TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g68300
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1276.6   13.76
 1252.8 
 1252.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1231.3   28.37
 1222.2  
 1178.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1435.3   55.75
 1327.2 
 1357.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  675.3   45.09
 588.5 
 610.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  543.5   9.09
 552 
 561.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  561.3   23.79
 596.3 
 550.9 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  539.5   35.75
 517.7 
 587.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  1763   71.18
 1870.7 
 1897.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  2404.5   15.41
 2434.3 
 2426.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  541.3   21.98
 584.2 
 554.2 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  503   20.07
 532.8 
 494.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1067.7   128.8
 962 
 811.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1275.5   39.94
 1198.9 
 1217.5 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  456.8   21.71
 464.6 
 423.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  729.6   25.84
 781.3 
 754.7 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  438.1   27.57
 416.3 
 471.1 
 3.20 Root (ATGE_93)  1825   27.1
 1879.2 
 1850.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  2270.1   258.82
 1963.9 
 2478.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  2120.2   63.87
 2214.1 
 2092.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1263   34.87
 1296.1 
 1226.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1187.4   83.97
 1329.3 
 1336.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1340.9   61.9
 1305.8 
 1426.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1253.1   27.45
 1255.4 
 1206.7 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  841.7   17.38
 811.2 
 812 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1510.8   22.47
 1518.6 
 1476.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1593.4   57
 1479.8 
 1544.6 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1444.2   45.35
 1404.5 
 1495 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1246.9   34.17
 1267.2 
 1200.5 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  997.6   36.4
 969.5 
 1041.7 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  744.1   41.86
 817.4 
 815.8 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1425.4   128.14
 1681.7 
 1557.4 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1544.9   145.35
 1288 
 1534.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  854.8   22.35
 889.8 
 896.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  911.3   14.99
 935.8 
 908.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  868.7   26.71
 887.5 
 834.8 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1619.1   60.3
 1561.4 
 1498.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1003.4   63.5
 921.2 
 878.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  779.9   42.13
 699.4 
 717.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  726.3   13.59
 752.7 
 745.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1412.1   68.47
 1452.6 
 1545.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1027.7   25.14
 1067.8 
 1074 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2143.8   30.51
 2129 
 2085.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1980.2   59.92
 1862.2 
 1903 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1815.6   46.3
 1907.6 
 1870.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  935.7   36.11
 864.6 
 910.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  806.9   26.76
 859.9 
 839.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  474.9   9.97
 461 
 455.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1626.3   253.3
 1228.5 
 1699 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1236.9   97.66
 1399.4 
 1224.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1206.3   15.17
 1219 
 1188.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  2824.7   152.08
 2546.8 
 2578.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1162.2   74.9
 1273.4 
 1304.7 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1072.3   41.57
 1154.2 
 1100.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  856.4   48.2
 796.7 
 761 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  697.9   17.29
 727.4 
 728.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  388.7   25.36
 399.7 
 437 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  382.4   23.92
 349.5 
 396 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  386   20.8
 347.6 
 353 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays