TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g69080
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  199.3   12.29
 219 
 221.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  251.8   9.57
 235.9  
 253.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  320.7   36.51
 254.4 
 314 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  277.7   21.02
 318.7 
 306.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  240.7   29.34
 283.9 
 227.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  195.2   15.76
 181.3 
 212.7 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  235.1   42.29
 303.2 
 312.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  324.6   34.46
 257.5 
 304.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  344.3   21.18
 358.6 
 386 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  302.2   13.77
 298.2 
 323.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  342.1   29.34
 284.4 
 303.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  365.6   14.18
 345.7 
 338.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  331.6   44.09
 403.1 
 322.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  290.8   21.49
 270.9 
 313.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  152.2   25.19
 147.4 
 193.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  257.8   23.01
 300.2 
 294.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  327   11.22
 310.6 
 332.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  310   29.83
 327.5 
 269.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  394.6   31.19
 333 
 355.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  274.8   14.96
 254.1 
 245.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  402.2   15.06
 382.9 
 412.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  263.2   9.22
 279.2 
 279.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  269.3   10.5
 286.7 
 267.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  329.2   40.97
 406.8 
 390.7 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  328.4   9.81
 311.3 
 328.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  324.1   20.16
 363.8 
 337.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  427.2   12.29
 409.6 
 403.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  343.6   9.45
 325 
 337.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  334.2   25
 384.2 
 358 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  350.5   33.82
 336.7 
 286.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  333.2   40.66
 414.3 
 378.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  295.4   32.2
 344.9 
 355.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  223.4   25.81
 184.9 
 174.3 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  197.3   18.03
 163.4 
 191 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  208   17.85
 172.7 
 185.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  241.5   16.11
 222.9 
 255 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  153.3   15.75
 182.2 
 178.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  238   12.56
 228.7 
 253.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  190   14.63
 160.9 
 177.7 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  187.7   30.61
 240.5 
 187.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  511   24.4
 551.4 
 507.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  222   35.95
 260.7 
 293.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  191.7   22.22
 222.3 
 179.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  165.7   21.01
 191.9 
 207.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  207   9.23
 220.1 
 202.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  175.5   13.49
 152.7 
 176.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  412.8   12.72
 433.5 
 410.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  232.8   15.28
 259.9 
 234 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  176   5.95
 178.7 
 187.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  353.4   17.58
 318.2 
 335.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  977.4   73.04
 871.7 
 837.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  213.8   21.81
 249.1 
 253.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  306   20.38
 271.5 
 269.9 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  343.4   36.47
 291.1 
 361.3 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  397.7   6.03
 409.7 
 404.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  722.1   108.11
 526.1 
 545 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  766.3   178.26
 968.8 
 613.4 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  742.5   92.63
 900.9 
 904.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays