TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g69600
TIGR annotation:zinc finger homeobox family protein / ZF-HD homeobox family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  87.9   6.08
 78.2 
 76.7 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  44.7   4.92
 45.6  
 53.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  29.5   6.39
 42.2 
 34.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  38.5   2.11
 42.2 
 42.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  40   2.66
 45 
 40.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  45.7   2.45
 48.4 
 50.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  38.2   1.26
 39 
 40.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  312.6   30.59
 372.3 
 353.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  192.3   9.35
 176.3 
 175.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  42.5   6.62
 40 
 30 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  48.4   2.6
 44.9 
 43.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  44.8   4.4
 37.7 
 36.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  37.7   2.82
 33.9 
 32.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  46.3   4.94
 37.6 
 46.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  207.9   10.06
 195.3 
 188 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  44.4   3.8
 38.3 
 37.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  156.2   13.01
 131.6 
 136.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  127.3   11.56
 138.8 
 115.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  107.1   8.49
 122.3 
 108.2 
 3.20 Roots (ATGE_9)  57.6   3.95
 65.2 
 63.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  33.6   6.53
 23.5 
 35.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  29.2   2.5
 31 
 34.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  36.4   3.03
 33.7 
 39.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  37.4   4.11
 45.6 
 41.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  28.8   7.5
 38.4 
 43.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  32.6   1.71
 33.1 
 35.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  33.6   2.47
 28.9 
 32.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  35.7   1.68
 36.5 
 33.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  37.9   1.87
 34.4 
 37.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  35.6   3.58
 33.7 
 40.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  42.4   1.97
 41.7 
 45.4 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  58.4   3.33
 51.7 
 55 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  230.2   6.15
 224.1 
 217.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  145.2   10.45
 132.1 
 152.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  94.6   4.18
 86.2 
 91.1 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  71.2   3.21
 65.1 
 66.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  104.4   4.37
 98.8 
 95.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  110.4   4.94
 100.6 
 106.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  90.8   6.62
 93.1 
 103.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  228.5   15.92
 211.4 
 243.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  79.7   6.35
 74.1 
 86.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  207.5   12.89
 182.4 
 200.1 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  298.7   8.24
 313.2 
 299.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  387   15.14
 414.4 
 411.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  132.8   8.87
 125.1 
 142.8 
 6.00 Flower (ATGE_92)  130   5.4
 136.7 
 140.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  125.4   16.16
 102 
 133.1 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  31.1   2.96
 31 
 36.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  33.4   2.21
 35.2 
 37.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  125.4   2.73
 125.6 
 120.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  31.9   5.57
 42.9 
 35.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  80.9   3.05
 87 
 83.2 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  124.3   6.34
 134.9 
 135.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  294.9   23.99
 247.1 
 274.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  301.3   3.78
 299.4 
 306.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  290.4   24.78
 339 
 323.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  290.5   26.92
 340.5 
 298.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  307.4   16.52
 326.5 
 340.3 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays