TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g71860
TIGR annotation:protein tyrosine phosphatase 1 (PTP1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1563.9   29.77
 1521.5 
 1506.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1413.8   39.36
 1359.1  
 1337.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  993.6   32.77
 934.8 
 989.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  928.6   22.66
 897.3 
 884.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1073.6   28.23
 1119.6 
 1125 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1206.6   50.78
 1253.2 
 1308 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  755.4   6.84
 741.8 
 749.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  1443.8   100.05
 1287.5 
 1257.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  1049.3   24.19
 1097.3 
 1078.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  771.2   26.95
 824.1 
 788.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  799.3   11.8
 779 
 799.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1111.3   76.8
 1235.8 
 1251.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1017.2   22.96
 998 
 1043.7 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  903.1   69.58
 1022.2 
 900.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1338.7   36.38
 1386.5 
 1315.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  843.9   56.23
 911.1 
 955.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  1131.7   35.61
 1060.5 
 1094.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  1250.4   22.11
 1206.4 
 1224.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  1140.5   14.41
 1151.6 
 1123 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1312.7   17.24
 1345.6 
 1338 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1204   30.24
 1145.6 
 1161 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1043   8.14
 1050.9 
 1059.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1079.3   34.84
 1015 
 1023.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  751.1   28.21
 799.4 
 749.9 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1070.9   34.66
 1028.4 
 1002.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1091.8   38.11
 1024.4 
 1027.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  993   25.72
 960 
 1010.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  927   10.04
 920 
 939.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  991.3   25.51
 961.8 
 940.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  943.7   31.97
 1006.4 
 964.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1210.9   59.97
 1091 
 1152 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1078.4   69.55
 941.2 
 1029.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1273.4   37.81
 1341.9 
 1279.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1143   49.39
 1045.9 
 1110.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1202   19.57
 1170.6 
 1206.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  975   30.9
 1013.9 
 1036 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1120.7   35.59
 1078.9 
 1049.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1067.4   35.82
 1004.4 
 1006.2 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1138.5   19.91
 1098.8 
 1121.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1197.3   12.96
 1178.8 
 1203.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  990.3   21.54
 971.5 
 947.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1280.5   15.93
 1310.7 
 1286.7 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1384.8   44.48
 1352.2 
 1440.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  981.9   12.06
 979.1 
 1001.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1206.9   32.73
 1209.2 
 1151.4 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1136.8   52.53
 1033.7 
 1102.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  362   10.47
 347 
 367.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1237.9   31.13
 1268.1 
 1300.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1278.4   26.89
 1269.4 
 1319.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1013.8   7.83
 1013.8 
 1000.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1868.8   143.37
 1594.2 
 1660.2 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  899   19.89
 922.8 
 883.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  777.7   28.59
 727.8 
 728.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  450.7   8.43
 449.4 
 464.6 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  318.9   18.53
 353.4 
 348 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  290.6   18.03
 315.8 
 325.5 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  277.2   17.7
 268.2 
 302.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  269.8   11.87
 268.6 
 289.8 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays