TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g75040
TIGR annotation:pathogenesis-related protein 5 (PR-5)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  67.3   2.76
 62.1 
 66.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  98.4   2.97
 96.4  
 102.2 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  2652.9   52.91
 2733.6 
 2752.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  343.3   4.52
 346.9 
 337.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  332.4   17.15
 310.5 
 298.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  344   10.1
 335.1 
 323.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  225.6   2.8
 223.4 
 229 
 1.03 Root (ATGE_94)  63   10.3
 63.3 
 81 
 1.03 Root (ATGE_95)  89.4   4.07
 83.1 
 90.7 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  801.4   8.54
 788.7 
 804.9 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  268.1   9.4
 277.5 
 286.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  165.8   15.3
 140.7 
 138.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  381.5   10.24
 377.5 
 362.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  244.9   13.67
 240.1 
 265.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  213.7   5.11
 219.9 
 209.7 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  368.8   26.83
 418.6 
 376.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  73.2   2.58
 69.9 
 68.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  64.2   6.07
 74.4 
 63.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  69.9   5.21
 59.6 
 65.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  65   2.46
 66.5 
 61.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1693.5   75.15
 1571.3 
 1708.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  3296.2   188.42
 3065.3 
 3438.6 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  2717.2   182.11
 2362 
 2469.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  144.3   5.75
 155.7 
 150.9 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2622.4   159.39
 2334.4 
 2596.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  5528.9   186.23
 5797 
 5886.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  4451.6   133.95
 4186.1 
 4349.8 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2928   119.18
 3103.9 
 3155.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  2020.6   13.2
 2043.2 
 2020.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  890.1   155.5
 1129.8 
 1181.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  183.6   5.5
 191.7 
 181.2 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  184.1   12.86
 206 
 183.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  119.3   8.86
 117 
 102.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  131.8   11.95
 108.4 
 115.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  453.7   74.08
 591.2 
 474.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2368.7   252.91
 2750.6 
 2272.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  92.6   7.41
 107.4 
 100.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  186.6   11.43
 209.4 
 199.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  716.6   27.13
 766.1 
 760.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  3867.7   180.14
 3512 
 3640.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1887.3   54.7
 1915.9 
 1993 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  8938.3   641.91
 8643.4 
 7708.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  154   10.19
 169.7 
 150.6 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  144.6   15.72
 159.5 
 128 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  501   6.52
 512.9 
 502.4 
 6.00 Flower (ATGE_92)  122.7   4.88
 118 
 127.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  378.4   12.1
 401.8 
 395.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  4168.4   202.7
 3952.7 
 4357.8 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  7064.1   342.01
 7258.7 
 6593.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  188.7   3.85
 185.9 
 181.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  2647.2   246.63
 2408.2 
 2901.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  292.7   17.31
 259.6 
 267.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  231   16.27
 254.4 
 262.2 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  77.2   11.24
 64.8 
 54.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  73.1   2.87
 72.4 
 67.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  91.7   8.13
 76.8 
 78.7 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  92.8   6.74
 80 
 90 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  102.2   12.95
 88.2 
 114.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays