TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g80830
TIGR annotation:NRAMP metal ion transporter 1 (NRAMP1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1925.3   26.3
 1884.9 
 1875.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  847   30.83
 890  
 906.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1206.2   18.9
 1168.4 
 1188.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  403.8   26.38
 455.9 
 437.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  822.9   44.28
 855.1 
 910.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1390.1   66.34
 1399.5 
 1509.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  793.9   37.63
 723 
 736.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  2201.4   174.49
 1872.3 
 1936.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  1602.8   72
 1734.5 
 1719.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  338.4   2.97
 336.1 
 342 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  459.7   17.14
 493.1 
 483.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  624.9   9.33
 639.8 
 642.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  778.3   39.22
 719 
 793.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  451.1   34.27
 491.7 
 423.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  351.8   8.25
 352.1 
 366.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  418.8   15.18
 439.1 
 448.5 
 3.20 Root (ATGE_93)  1555.9   86.37
 1564.3 
 1410.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  3223.7   283.28
 2739.1 
 3235.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  3102.1   166.02
 3011.4 
 3333.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1685.7   23.28
 1696.9 
 1730.5 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  928.2   56.04
 831.5 
 830.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  933.7   25
 894.3 
 940.6 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  782.7   21.25
 813.2 
 772.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  362.3   53.41
 463.8 
 442.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1841.1   31.87
 1887.8 
 1826.9 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1364.4   68.65
 1250.1 
 1373.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  958.6   13.31
 956.1 
 980.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  577   13.62
 598 
 602.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  398.9   12.14
 423.1 
 412.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  383.4   9.32
 391.2 
 402 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  920.6   41.16
 845.3 
 911.7 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1108.4   88.04
 975.8 
 941.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  694.8   18.26
 711.4 
 674.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  853.3   23.57
 870 
 823.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  900   20.56
 939 
 908.2 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1629.8   35.98
 1630.4 
 1692.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  303.5   8.45
 317 
 301.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  306.5   17.79
 311 
 278.2 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  525.1   11.36
 503.1 
 509.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1305.3   5.53
 1313 
 1316.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  570   26.74
 621.4 
 582.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2565.2   33.34
 2502.6 
 2553.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1604.3   24.61
 1650 
 1611.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1045.2   49.49
 1087.1 
 988.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  556.8   26.04
 545.2 
 507.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  575.7   21.97
 586.6 
 618 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  325.4   14.33
 340.4 
 354 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1188.1   25
 1187.2 
 1230.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1129.7   47.99
 1105.2 
 1037.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  960.9   30.01
 935.1 
 901 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1070   26.95
 1079.1 
 1028.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1250.7   38.03
 1326 
 1297.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1309.7   35.21
 1318.9 
 1253.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  994.3   25.65
 1039.6 
 1037.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  964.3   28
 925.6 
 980 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  597.5   31.08
 659.6 
 629.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  634.1   56.96
 558.1 
 669.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  653.9   33.76
 616.7 
 586.5 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays