TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g04240
TIGR annotation:zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  599.1   29.55
 598.1 
 547.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  403.7   20.18
 367.6  
 370 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  413.3   16.27
 401.6 
 381.1 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  304   11.85
 314.9 
 327.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  249.4   20.01
 289.1 
 264.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  309.2   14.37
 327.4 
 337.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  294.3   27.96
 334.7 
 348 
 1.03 Root (ATGE_94)  908.7   37.64
 943.2 
 983.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  770.7   25.66
 798 
 822 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  336   13.65
 361.1 
 358 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  383.3   28.4
 437.1 
 426.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  469.5   11.61
 459.2 
 446.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  621.4   29.56
 594 
 562.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  408.8   8.58
 392.2 
 404.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  635.2   33.99
 653.3 
 701 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  393   6.24
 404.7 
 395.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  689.5   19.8
 691.1 
 656 
 3.20 Root (ATGE_98)  1141.8   33.52
 1084.8 
 1082.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  935.6   26.73
 951.9 
 899.7 
 3.20 Roots (ATGE_9)  670.1   38.27
 644 
 719.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  593.4   28.01
 648.3 
 630.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  706.8   17.18
 723.9 
 741.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  591.8   32.36
 655.8 
 632.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  577.3   4.44
 586.2 
 582.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  516.4   9.41
 530.1 
 512.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  564.4   16.35
 595.8 
 587.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  560.5   15.3
 554.3 
 531.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  543.3   4.73
 549.4 
 540.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  493.8   13.58
 511.2 
 520.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  449.4   11.86
 444.6 
 426.9 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  472.5   11.63
 492.8 
 492.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  680   42.17
 600.8 
 665.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  948.7   25.75
 908.3 
 900.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1005.8   8.21
 1021.5 
 1009.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  823.9   16.67
 798.7 
 830.2 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  542.2   2.27
 542.6 
 546.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  734.5   10.16
 751.9 
 734.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  552   50.69
 542.6 
 459.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  760.9   31.8
 817 
 814.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1039.2   12.97
 1025.6 
 1051.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  831.1   36.03
 899.5 
 845.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  796.9   16.97
 804.8 
 772.3 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1155.4   114.34
 1211 
 991.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1106.6   48.98
 1194 
 1188.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  793.2   9.69
 775.2 
 790.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  725.3   35.34
 663.3 
 664.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  262.2   14.24
 233.7 
 247.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1280.6   80.44
 1140 
 1278.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1738.6   6.86
 1738.4 
 1750.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  769.8   17.72
 752.8 
 734.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1330.3   17.57
 1297.2 
 1303.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  711.7   26.25
 761.9 
 750.1 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  733.1   7.99
 717.7 
 721.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  988.3   29.83
 1008.3 
 1047 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  959.5   28.04
 985.1 
 929.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1649.8   37.81
 1723.9 
 1674 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1339.1   31.49
 1338.6 
 1393.4 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1568.6   108.98
 1729.7 
 1776.3 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays