TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g18950
TIGR annotation:homogentisate phytylprenyltransferase family protein (HPT1) / tocopherol phytyltransferase family protein (TPT1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  165.4   4.14
 157.5 
 163.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  687.3   31.4
 634.6  
 631.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  459.9   11.54
 454.4 
 437.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  536.3   11.59
 550.5 
 559.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  986.7   42.09
 999.1 
 1065 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  884.7   41.55
 949.6 
 962.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  948.6   51.47
 888.3 
 846.2 
 1.03 Root (ATGE_94)  229.7   23.63
 215.1 
 183.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  213.4   14.83
 235.8 
 241.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  714.5   23.64
 761.8 
 737.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  598.6   18.08
 631 
 628.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  290.2   9.47
 298.5 
 309.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  470.8   19.58
 435.4 
 467.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  830.5   44.13
 914.5 
 849.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1010.3   27.65
 984.2 
 955.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  881.1   32.24
 876 
 822.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  320.8   8.84
 323.1 
 306.8 
 3.20 Root (ATGE_98)  358.9   14.33
 373.5 
 387.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  397.8   3.41
 403.3 
 404 
 3.20 Roots (ATGE_9)  128   6.26
 117.2 
 117.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  503.1   9.83
 495.3 
 514.9 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  411.2   31.67
 433.4 
 370.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  499.6   17.14
 498.1 
 469.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  491.2   13.05
 465.4 
 475.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  639   56.44
 678.9 
 750.4 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  496.8   22.1
 462 
 503 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  437.8   31.81
 428.3 
 487.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  492.1   29.74
 486 
 540.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  573.6   21.05
 542.4 
 533.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  789.1   35.48
 719 
 744.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  495.9   21.99
 457.3 
 458.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  626.7   52.57
 595.1 
 524.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  913.4   4.22
 919.8 
 921.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  853.6   45.46
 940.6 
 874.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  844.4   6.38
 846.3 
 834.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  836.7   36.87
 843.9 
 903.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1024.9   24.55
 980 
 985.3 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  407.2   23.58
 369.5 
 412.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  900.5   35.46
 864.9 
 829.5 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  938.4   39.08
 897.7 
 860.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  641.2   64.29
 765 
 673.1 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1984.8   72.41
 1963.6 
 1850.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1071.7   67.6
 988.7 
 1122.6 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  696.4   24.2
 728.8 
 681.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  720.1   39.38
 767.2 
 689 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1051.9   39.49
 1050.7 
 982.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  90.4   9.02
 106.4 
 105.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  840   74.09
 967.8 
 838.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  3004.3   155.09
 2696 
 2880.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  558.6   14.04
 539.1 
 531.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  281.8   21.77
 246.1 
 242.4 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  707.7   6.34
 713.3 
 700.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  966.4   12.38
 954.4 
 941.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1119.6   58.79
 1234.7 
 1156.3 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1067.2   38
 1084.1 
 1139.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  336.2   33.57
 403.2 
 372.8 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  340   39.92
 297.1 
 376.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  270.4   19.33
 263.8 
 234.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays