TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g21940
TIGR annotation:shikimate kinase, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  242.3   5.35
 231.9 
 239.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  234   15.78
 203.6  
 225.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  208   8.18
 202.8 
 218.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  136.1   10.9
 152.1 
 156.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  158.4   1.9
 154.7 
 155.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  158.4   1.42
 158.9 
 156.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  158.7   3.43
 162.4 
 155.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  350.3   10.38
 330.1 
 344.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  290.5   27.43
 344.7 
 324.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  172.6   3.13
 178.8 
 175.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  177.3   10.68
 195.3 
 176.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  173   2.4
 169.6 
 174.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  193.1   1.39
 195.9 
 194.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  145.5   13.31
 171.6 
 163.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  181   5.65
 192.1 
 188.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  158.4   2.66
 158.3 
 163 
 3.20 Root (ATGE_93)  323.6   31.8
 362.7 
 299.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  367.3   2.47
 366.9 
 362.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  358.5   17.44
 327.3 
 329.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  264.3   15.81
 289.1 
 293.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  193.6   13.01
 214.5 
 217.4 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  201.8   9.51
 219.8 
 205.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  204.2   15.12
 198.4 
 175.6 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  195.4   6.8
 192 
 205.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  295.4   4.24
 301 
 292.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  270.6   1.1
 272.8 
 271.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  241.6   5.96
 250.4 
 252.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  210.7   12.71
 209.1 
 231.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  187   2.26
 183.5 
 182.7 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  167.3   4.61
 160.4 
 158.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  190.5   8.61
 174.2 
 187.2 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  236.5   14
 226.4 
 254.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  189.7   3.15
 187.7 
 193.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  194.5   3.13
 195.7 
 200.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  206.1   6.85
 192.6 
 201.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  259.1   9.36
 277.3 
 271.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  397.5   4.31
 406.1 
 400.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  199.3   8.56
 187.9 
 204.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  328.9   2.61
 323.9 
 325 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  759.6   19.04
 766.1 
 795.4 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  238.4   12.16
 240.2 
 218.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  378.7   19.8
 416.4 
 408.1 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1484.2   90.41
 1452 
 1314 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1236.3   24.61
 1240 
 1195.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  317.4   10.94
 314.6 
 334.8 
 6.00 Flower (ATGE_92)  194.8   5.63
 189 
 183.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  126.1   10.54
 146.6 
 140.7 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  376.7   15.56
 345.6 
 362.5 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  444.3   3.23
 438.3 
 443.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  249.8   6.89
 253.8 
 263.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  418   3.86
 411.7 
 411 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  256.7   18.09
 247.3 
 282.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  223.1   4.58
 231.8 
 224.9 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  207.5   7.88
 194.5 
 208.7 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  233.7   13.65
 259.3 
 254.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  496.3   8.98
 514.1 
 507.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  424.1   23.65
 452.2 
 405.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  521.8   23.2
 546.4 
 500 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays