TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g25940
TIGR annotation:vacuolar processing enzyme alpha / alpha-VPE
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  84   2.97
 89.5 
 84.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  149.1   5.86
 160.1  
 158 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  54.5   6.7
 49.3 
 62.6 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  59.4   6.93
 71 
 71.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  56.8   1.27
 59.3 
 58 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  59.1   2.27
 63.7 
 61.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  53.5   5.74
 60.2 
 64.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  207.1   9.3
 195.4 
 213.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  232.3   16.05
 264 
 252.4 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  58.5   3.36
 61.1 
 65.1 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  60.5   0.49
 61.4 
 61.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  82.3   5.41
 75.1 
 71.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  75.4   3.51
 79 
 71.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  75.8   8.03
 61.7 
 75.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  60.1   4.36
 54.8 
 51.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  78.6   9.15
 74.1 
 61 
 3.20 Root (ATGE_93)  287.4   9.28
 274.4 
 269.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  283.5   5.19
 275.8 
 285.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  340.4   16.26
 331.3 
 308.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  83.8   4.33
 76.1 
 83.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  68.2   5.61
 57.2 
 61 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  58.7   3.49
 57.5 
 64.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  57   11.22
 58.1 
 77 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  54.2   11.48
 74.6 
 73.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  65.3   14.14
 60.7 
 87.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  67.9   4.83
 58.3 
 62.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  73.4   5.41
 63.4 
 64.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  58.4   3.68
 61.1 
 65.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  71.4   10.51
 82 
 61 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  64.2   3.98
 58.5 
 66.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  85.1   3.04
 79 
 82.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  84.8   7.8
 95.4 
 80.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  69.1   2.66
 64.5 
 64.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  78.6   8.33
 64 
 64.3 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  71.6   8.57
 65.8 
 54.8 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  73.6   1.81
 72.9 
 76.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  74.6   5.76
 86.1 
 81.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  69.9   0.83
 68.7 
 68.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  68.3   3.36
 61.9 
 66.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  68.9   4.27
 77.4 
 72.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  72.7   2.39
 70.4 
 75.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  78   3.73
 71 
 72.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  137.6   1.89
 141.4 
 139.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  144.6   8.28
 154.5 
 161 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  88.4   2.58
 83.5 
 84.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  52.6   6.68
 63.5 
 64.8 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  175.5   25.15
 187 
 223.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  77.2   3.41
 73.9 
 80.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  108.7   1.43
 111.3 
 110.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  79   3.71
 73 
 79.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  164.5   15.09
 139.3 
 137.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  634.9   29.81
 665.9 
 694.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1723   74.73
 1633.7 
 1574.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2150.4   108.42
 2367 
 2249.4 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2929.1   248.81
 2482.4 
 2895.5 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1954.8   175.28
 2304.2 
 2105.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  2210.5   69.01
 2117.3 
 2252.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1759.1   80.09
 1774.9 
 1628.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays