TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g28160
TIGR annotation:basic helix-loop-helix (bHLH) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  178.7   4.55
 185.8 
 187.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  66.9   5.17
 64.8  
 74.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  78.2   2.32
 79.1 
 74.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  89.9   3.05
 86 
 92 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  72.1   4.39
 69.2 
 77.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  73.4   3.06
 69.7 
 75.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  74.8   6.72
 88.3 
 81.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  289.1   6.72
 276.4 
 278.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  197.6   14.29
 212.3 
 183.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  99.4   9.7
 81.9 
 83.5 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  79.7   7.07
 71.7 
 65.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  82.3   4.4
 85 
 76.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  69.4   2.93
 67.7 
 73.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  77.8   6.52
 68 
 80.4 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  60.2   7.91
 59 
 73.3 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  80.2   0.27
 80.8 
 80.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  280.4   2.14
 283.6 
 279.6 
 3.20 Root (ATGE_98)  186.2   7.14
 196.8 
 199.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  155.7   2.98
 150 
 154.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  149.6   2.6
 144.5 
 148.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  77   5.89
 65.5 
 73.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  85.8   9.1
 71.3 
 88 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  76.2   5.82
 87.6 
 84.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  75.3   6.96
 75.4 
 87.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  82.4   10.03
 80.9 
 99 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  77.4   5.26
 83.5 
 73 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  100.4   11.16
 85.6 
 78.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  87.3   7.65
 72 
 80.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  78.9   6.73
 91.4 
 89.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  89.9   8.18
 73.8 
 79.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  85.3   12.79
 62.6 
 84.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  71.3   8.09
 80.4 
 87.4 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  67.1   3.21
 61.3 
 61.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  73.3   9.59
 54.5 
 60.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  68.3   2.66
 64.6 
 63.1 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  69.4   2.76
 74.4 
 69.9 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  76   8.42
 83.9 
 92.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  78.8   12.41
 99.3 
 76.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  65.9   3.63
 65.6 
 72 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  76.2   6.08
 64.1 
 69.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  86.6   8.59
 90.9 
 103.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  74.9   5.66
 85.2 
 84.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  91.9   11.11
 80.3 
 69.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  87.2   9.5
 75.9 
 94.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  65.7   4.81
 74.9 
 67.7 
 6.00 Flower (ATGE_92)  66.8   5.93
 55.7 
 64.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  156.5   11.54
 135.9 
 137.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  83.7   7.22
 95.3 
 96.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  94.5   2.68
 98 
 99.7 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  79.8   7.8
 67.7 
 65.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  64.8   8.78
 81.8 
 77 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  54.7   4.8
 62.1 
 63.8 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  61.7   4.03
 62 
 68.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  63.5   4.27
 64.1 
 71.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  68.7   8.29
 58.2 
 74.5 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  88.7   12.99
 63.2 
 71.6 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  92.1   5.09
 101.1 
 100.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  79.2   11.2
 90.2 
 101.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays