TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At2g30580
TIGR annotation:zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  182.9   8.05
 181.9 
 168.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  163.4   6.08
 156  
 151.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  138.2   3.82
 131.2 
 137.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  152   10.75
 131.8 
 135.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  164.6   6.79
 151.1 
 157.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  180.6   5.5
 183 
 172.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  174.6   5.97
 162.8 
 166.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  152.4   4.67
 147.3 
 143.1 
 1.03 Root (ATGE_95)  151.6   11.88
 134.6 
 157.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  132.2   9.21
 120 
 138 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  140   5.97
 146 
 134.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  167.1   1.53
 170.1 
 168.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  139.5   5.52
 134.7 
 145.7 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  158.1   9.88
 164.7 
 145.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  190.5   7.14
 195 
 181 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  155.2   4.23
 157.1 
 163.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  139.3   3.05
 134.4 
 140 
 3.20 Root (ATGE_98)  150.6   4.12
 142.7 
 148.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  154.3   3.94
 150 
 157.9 
 3.20 Roots (ATGE_9)  152.2   4.5
 154.8 
 146.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  128   10.8
 142.8 
 149 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  169.7   11.89
 173.5 
 151.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  144.6   7.49
 147.4 
 133.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  127.5   11.11
 121.1 
 105.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  172.3   5.1
 181.8 
 173.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  163.9   5.42
 153.6 
 155.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  141.9   3.91
 134.4 
 140.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  128.6   14.77
 117.9 
 147.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  125.2   5.9
 132 
 136.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  137.3   2.8
 139 
 142.8 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  150.5   9.36
 168.2 
 164.6 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  150   4.66
 158.9 
 152.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  241.2   5.02
 244.1 
 234.3 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  196   8.72
 198.5 
 212.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  195.9   3.93
 203.2 
 201.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  188   7.34
 190.8 
 176.9 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  206.5   10.37
 194 
 185.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  540.5   12.48
 526.3 
 515.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  229.4   3.95
 223.8 
 231.4 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  183.5   1.57
 181.2 
 180.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  128.4   0.8
 128.3 
 127 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  294   15.18
 303.6 
 273.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  223   14.26
 204 
 232 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  314.9   9.09
 301.4 
 318.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  186.4   1.63
 185.9 
 183.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  190.9   6.73
 200 
 186.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  747.9   116.49
 968.8 
 794.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  163.2   3.41
 167.9 
 161.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  244.5   5.11
 236.4 
 245.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  179.7   2.53
 174.8 
 176.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  161.6   10.87
 163.4 
 143.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  286.3   8.31
 269.7 
 278.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  355.5   17.44
 350.4 
 323.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  462.6   27.25
 491.1 
 517 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  526.3   26.76
 537.3 
 577.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  305.2   29.15
 259.6 
 313.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  266.3   7.07
 266.7 
 278.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  195.7   17.2
 229.8 
 209.3 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays