TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g34250
TIGR annotation:protein transport protein sec61, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2535.5   52.45
 2636.6 
 2561.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  2338.4   68.83
 2262.1  
 2399.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1788   41.5
 1794.3 
 1719.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1555.7   45.64
 1646.1 
 1590 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  3069   9.63
 3087.9 
 3081.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  3645.2   228.76
 3219.3 
 3577 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  2203.6   145.6
 2070 
 1912.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  2684.2   158.84
 2487.6 
 2369.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  2476.2   134.66
 2694.2 
 2448.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1942.7   28.46
 1889.5 
 1933.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1538.8   41.04
 1617.5 
 1598.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2347   107.63
 2562.3 
 2451.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2358.7   43.01
 2434.5 
 2361.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1933.7   171.3
 2131.9 
 1790.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  3018.7   373.32
 3478.8 
 2739.6 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  2361.8   145.06
 2124 
 2386.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  2555.3   41.89
 2626.1 
 2551.8 
 3.20 Root (ATGE_98)  2482   162.14
 2162 
 2367.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  2709   49.83
 2639.6 
 2612.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  2353.5   16.17
 2368 
 2385.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  2360.7   152.23
 2160.3 
 2062 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  2145.6   73.24
 2031.8 
 2008.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  2129.6   113.32
 1956 
 2169 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1708.1   24.62
 1668.6 
 1713.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2119.5   51.97
 2108 
 2024.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2228.3   136.99
 2062.9 
 2334.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2232   25.54
 2241.4 
 2193.2 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2189.5   72.82
 2302 
 2165.7 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1992   46.71
 2080.8 
 2061.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  2138.7   45.2
 2142 
 2062.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2176.9   21.15
 2199.8 
 2219.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2196.8   152.94
 2177.5 
 1922.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  3602.5   176.67
 3564.6 
 3887.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2818.4   121.89
 2860.3 
 3047.3 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  3231.8   200.57
 2830.7 
 3024.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1978.2   12.65
 2002.6 
 1984.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2228.2   38.79
 2277.6 
 2304.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  3725.4   127.19
 3700.7 
 3493.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  2703.6   53.7
 2728.8 
 2625.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  2027.9   71.6
 2058.2 
 2164.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  2006.6   19.47
 2032.7 
 1994.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2207   80.03
 2060.5 
 2078 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1242.4   69.68
 1268.9 
 1374.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1374.2   13.13
 1386.2 
 1400.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  3274.5   106.45
 3079.2 
 3250.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  3497.1   120.58
 3291.9 
 3504.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  2281.9   361.76
 1697.3 
 1620.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  2010.6   167.01
 2340 
 2127 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  3404.4   275.76
 3023.4 
 2868.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2593.9   80.34
 2628.2 
 2475.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1955.1   35.82
 1886.6 
 1939 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  3170.1   192.86
 3079.2 
 2800 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  4368.3   286.07
 3863 
 3883.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  4352.8   166.51
 4685.8 
 4517.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  4404.3   143.82
 4531.2 
 4244.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  3172   111.49
 2952.8 
 3097.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  3298.1   95.11
 3115 
 3161.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  2720.9   166.36
 2746.1 
 2446.2 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays