TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g35930
TIGR annotation:U-box domain-containing protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1376.8   67.48
 1274.1 
 1401.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  768.3   98.57
 952.2  
 921.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1626.2   49.62
 1607.5 
 1532.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  539.3   24.49
 496.5 
 497.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  605.3   18.73
 639.3 
 636.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  298.2   24.89
 290.7 
 337.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  113.4   1.78
 116.2 
 116.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  1162.4   155.23
 1144.6 
 1421.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  961.6   67.97
 982.5 
 855.7 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  128.2   6.11
 137.4 
 125.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  188.5   3.39
 186.9 
 182 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2181.3   96.05
 2049.8 
 1994.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1039   82.22
 967.7 
 875 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  263.2   18.71
 270.3 
 298.6 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  60.9   1.98
 58.7 
 56.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  261.6   14.58
 277.8 
 290.7 
 3.20 Root (ATGE_93)  655.7   8.13
 641.6 
 655.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  1643.5   78.63
 1754.7 
 1602.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  938.3   12.59
 951.5 
 963.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1386.2   13.53
 1400.6 
 1373.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  357.7   7.85
 371.5 
 371 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  635.1   7.75
 646.4 
 649.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  507.9   10.03
 513.9 
 494.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  173.3   16.53
 188.6 
 206.3 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1029   16.76
 1062.4 
 1048.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  677.8   42.53
 707.3 
 623.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  703.1   31.23
 714.4 
 762 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  587.3   25.21
 593.3 
 633.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  588.4   14.42
 606.5 
 578 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  498.8   9.77
 493 
 512 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2933.9   237.86
 2637.5 
 2463.4 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1473.1   64.51
 1344.2 
 1414.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  161.5   7.73
 158.5 
 173.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  71.6   2.37
 67.1 
 70.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  43.9   5.27
 43 
 34.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  61.7   0.25
 61.9 
 61.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  51.3   3.91
 46.7 
 43.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  47.1   5.57
 51 
 40 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  49.8   0.96
 51.1 
 49.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  57.7   5.79
 46.3 
 50.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  76.5   3.09
 82.4 
 80.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  65.2   14.01
 57.9 
 85 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  47.1   5.48
 47.6 
 56.8 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  45.2   5.67
 46.2 
 55.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  42.9   2.52
 39.6 
 44.6 
 6.00 Flower (ATGE_92)  85.6   3.14
 79.6 
 81.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  666.2   120.68
 855.1 
 890.8 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  176   9.88
 156.3 
 166.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  209.2   14.04
 212.6 
 186.7 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  67.4   10.99
 45.6 
 54.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  95.1   6.96
 90.4 
 104.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  48.2   2.47
 53 
 51.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  34.4   4.63
 37.3 
 43.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  46.2   2.09
 42.1 
 44.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  32.2   3.55
 37.5 
 39 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  77.6   9.26
 60.5 
 75.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  60.6   2.77
 65 
 59.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  62.6   9.19
 57.8 
 75.5 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays