TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g38240
TIGR annotation:oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  247.5   3.31
 241.1 
 242.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  151.3   3.93
 148.1  
 156 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  340.5   14.18
 336 
 362.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  306.5   16.18
 324.6 
 338.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  271.6   22.62
 316.2 
 287.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  188.7   20.13
 202.9 
 228.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  201.7   14.35
 229.7 
 210.3 
 1.03 Root (ATGE_94)  156.1   14.77
 130.3 
 130.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  134.6   4.13
 140.3 
 132.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  250.1   19.91
 286.9 
 255.2 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  413.7   6.01
 414.3 
 424.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  276.6   8.88
 285.9 
 294.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  259.1   15.2
 278.8 
 248.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  260.6   12.47
 254.8 
 278.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  190.3   27.44
 155.7 
 209.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  283.5   15.11
 309.1 
 310.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  161.6   19.96
 137.3 
 122 
 3.20 Root (ATGE_98)  145.9   5.49
 141.8 
 135 
 3.20 Root (ATGE_99)  156.2   1.43
 154.7 
 157.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  161.4   9.12
 149.9 
 167.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  716.9   20.99
 685.2 
 677.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  754.8   29.05
 808.9 
 800.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  618.1   30.6
 668.3 
 612.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  235.8   20.23
 268 
 273.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  513.8   10.37
 534.3 
 521.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  518.5   17.64
 483.3 
 498.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  465.4   18.46
 479.6 
 502 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  413.3   34.04
 481.3 
 444.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  349.4   42.57
 399.1 
 314.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  248.4   12.36
 270.7 
 268.8 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  335.6   10.54
 353.3 
 334.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  352.6   7.48
 338.7 
 340.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  156.1   9.58
 163 
 144.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  176.9   11.66
 153.6 
 164.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  335.9   11.44
 358.5 
 343.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  253   14.71
 271.3 
 242.2 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  327.8   21.91
 360.5 
 369.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1996.8   82.34
 2019.2 
 1866.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  170.7   5.44
 171.2 
 161.5 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  454.8   8.79
 463.3 
 445.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  242.7   28.76
 275.2 
 300 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  454   31.12
 446.6 
 503.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  492.6   13.26
 497.2 
 472.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  2156.5   103.33
 2215.4 
 2014.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  189.2   6.52
 198.1 
 201.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  159.2   10.79
 145.4 
 166.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  298.6   12.39
 316.5 
 322.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  192.1   17.61
 217.5 
 183.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  170   9.47
 156.9 
 151.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  241.3   25.49
 223.1 
 273.5 
 6.50 Stem (ATGE_27)  157.2   11.71
 178.1 
 158.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  121.8   24.71
 138.3 
 170.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  168.7   22.09
 130.5 
 130.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  145.3   5.46
 148.6 
 138 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  186.9   7.22
 172.5 
 178.9 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  872   25.35
 905.5 
 855.8 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1141.5   23.24
 1127.2 
 1172.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  658.7   28.06
 702.1 
 711.2 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays