TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g38710
TIGR annotation:AMMECR1 family
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1304.8   17.73
 1269.8 
 1292.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1098.5   35.56
 1071.9  
 1028.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  884.5   31.88
 869.8 
 930.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  704.8   21.66
 680.7 
 723.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  916.1   73.99
 1059.8 
 957.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1120.1   62.39
 1139.3 
 1236.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  679.3   48.35
 729.8 
 775.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  1215.4   51.79
 1154.8 
 1257.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  1448.4   45.01
 1532.9 
 1517.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  705.9   22.83
 704.6 
 744.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  839.4   14.86
 868.6 
 858.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  655.5   10.62
 636.8 
 637.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  711.5   75.18
 833.2 
 848.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  853.4   16.62
 878.2 
 884.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1350.4   46.97
 1333.3 
 1261.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  897.2   17.54
 920.3 
 931.5 
 3.20 Root (ATGE_93)  1559   61.24
 1595.7 
 1476.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  1212.1   63.53
 1089.5 
 1179.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  1471.4   59.95
 1473.4 
 1368.6 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1192.7   6.69
 1201.1 
 1187.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  887.3   22.64
 846.3 
 850.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  772.6   18.57
 792.3 
 809.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  814.9   34.5
 827.9 
 762.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  767.1   21.94
 753.2 
 724.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  984.6   82.59
 1064.2 
 899.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  910.5   39.89
 836.8 
 900.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  860.6   52.51
 836.7 
 937.2 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  762   24.63
 767 
 806.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  776.7   32.32
 792.2 
 730.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  811.6   26.83
 864.8 
 844.4 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  847.7   87.61
 672.5 
 759.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  946.1   43.83
 858.5 
 899.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1000.7   94.45
 1187.8 
 1072 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1153.4   18.84
 1120.4 
 1152.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1073.9   39.24
 1135.3 
 1146.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1325.8   45.69
 1269.2 
 1359.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1044.3   37.02
 1089.8 
 1117.6 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1323.5   70.52
 1267 
 1183.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1076.2   16.36
 1051.9 
 1083 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1460.7   43.02
 1402.5 
 1376.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  788.9   28.47
 738.3 
 786.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2206.8   81.29
 2323.4 
 2363.1 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  2395.4   109.59
 2178.9 
 2316.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1339.4   30.74
 1378.8 
 1318.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1121.3   29.38
 1079.3 
 1135.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1116.3   37.67
 1135.3 
 1188.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  288.1   14.27
 279.4 
 307.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1063.2   46.89
 1016.1 
 1109.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1972.3   80.17
 1962 
 1828.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1173.9   43.2
 1142.1 
 1088.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  2080.6   121.83
 1851.6 
 1893.9 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2593.9   176.56
 2332 
 2668 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2908.3   122.37
 2733.7 
 2672.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2418.2   152.66
 2611.6 
 2719.5 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2775.9   49.4
 2849.9 
 2869.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1795.5   68.73
 1917.2 
 1911.8 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1370.2   259.51
 1812.7 
 1826.4 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1482.9   35.09
 1522.7 
 1552.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays