TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g39810
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  379   27.56
 337.5 
 326.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  310.5   9.31
 328.5  
 323.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  278.2   17.55
 287 
 253.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  301.7   10.87
 321.9 
 304.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  393.4   24.97
 411.8 
 362.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  413.8   23.7
 419 
 457.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  384.9   19.74
 367.2 
 345.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  252.6   10.89
 273.7 
 267.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  248.1   1.77
 248.2 
 245.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  353.7   7.35
 339 
 347.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  315.1   19.87
 275.9 
 289.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  283.5   20.73
 321.5 
 316.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  311.6   9.15
 316.9 
 299 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  336.8   25.87
 385.6 
 346.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  442.5   22.62
 439.4 
 480.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  362.2   39.63
 358.1 
 428.7 
 3.20 Root (ATGE_93)  259.3   17.84
 251.4 
 225.2 
 3.20 Root (ATGE_98)  336.2   11.58
 314.7 
 333 
 3.20 Root (ATGE_99)  290.4   4.03
 288 
 282.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  336.3   20.85
 339.5 
 373.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  324.9   18.47
 288.4 
 311.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  264.8   12.59
 250.2 
 275.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  281.2   12.06
 268 
 292 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  315.5   13.22
 335.4 
 340.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  265.8   6.08
 263.3 
 274.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  257.6   11.96
 281.1 
 273.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  292.7   20.17
 259.4 
 295.8 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  292.1   15.6
 287.3 
 263 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  319.9   9.29
 321 
 304.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  341   7.09
 330.8 
 344.5 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  356.4   5.7
 353.3 
 345.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  346.6   20.23
 374.1 
 334.7 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  359.7   12.42
 342.1 
 366.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  329.5   18.62
 337.3 
 364.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  348.7   26.11
 310.5 
 360.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  274.5   3.88
 269.1 
 276.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  278.4   6.65
 265.2 
 273.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  201.8   3.64
 199.8 
 206.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  390.7   11.97
 393.9 
 412.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  228.9   9.59
 246 
 245 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  286.4   8.06
 302.3 
 292.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  218.1   14.18
 237.2 
 209.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  182.9   5.98
 185.5 
 174.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  197.2   3.91
 190.1 
 191 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  343   8.01
 327 
 334.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  392.7   8.22
 390.9 
 405.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  297.2   10.25
 317 
 311.8 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  268.9   10.86
 290.5 
 280.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  270.4   7.02
 282.9 
 282.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  249.2   5.16
 252.4 
 259.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  255.6   13.43
 267.6 
 240.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  246   22.67
 280.8 
 238.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  260.9   11
 241.8 
 260.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  273.7   6.13
 269.5 
 281.6 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  276.1   20.89
 294 
 252.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  301.1   4.88
 305 
 295.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  320.2   1.39
 317.4 
 318.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  331.3   9.17
 313 
 322.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays