TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At2g42540
TIGR annotation:cold-responsive protein / cold-regulated protein (cor15a)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  59.3   5.87
 59.5 
 69.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  106.3   3.97
 98.5  
 103.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1730.6   30.77
 1791.7 
 1767.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  583.7   23.34
 623.7 
 624.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  405.3   12.2
 385 
 383.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  300.3   6.85
 290.7 
 287.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  478.3   21.84
 520.5 
 489.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  73.4   4.15
 65.8 
 66.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  56.4   4.21
 64.6 
 59.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  454.4   18.17
 489.9 
 465.6 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  3042.5   14.75
 3032.2 
 3061.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  119.8   17.7
 145.6 
 153.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  165.6   8.14
 168.8 
 153.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1325.3   44.11
 1285.4 
 1373.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  121.5   5.33
 112.7 
 122.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  1353.2   50.92
 1322.3 
 1421.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  81.9   4.49
 75.4 
 84 
 3.20 Root (ATGE_98)  66.1   3.11
 61 
 66.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  75.2   6.09
 69.5 
 81.7 
 3.20 Roots (ATGE_9)  65.4   5.72
 61.2 
 54 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  2405.4   282.67
 2969.7 
 2716.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  2838.6   134.85
 2833.7 
 2602.6 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  2281.3   10.08
 2268.2 
 2261.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  2841.7   41.31
 2864.4 
 2784.3 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  5198.9   74.64
 5190.2 
 5323.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2748.1   99.14
 2566.9 
 2587.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2692.8   209.47
 2621.6 
 2299.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2114.8   99.45
 2174.6 
 2309 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1137.4   50.39
 1051.9 
 1140.8 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  708.1   14.15
 700.9 
 680.8 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  435.4   17.97
 408.9 
 443.2 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  768.5   20.04
 806.3 
 798.9 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  3254.1   77.37
 3125.6 
 3264.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  5945.3   265.83
 5666.9 
 6198.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  8539.2   233.26
 8196.8 
 8642.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  8984.9   59.78
 9103.3 
 9058.2 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  8791.3   1285.65
 6450 
 6700.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  10034.2   256.65
 9525 
 9835.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  517.5   15.21
 516.5 
 490.7 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  2977.3   111.11
 2787 
 2981.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  3325.7   89.22
 3202.9 
 3152.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  4628.3   332.12
 4691.5 
 4087.3 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  7913.8   448.99
 7042 
 7291.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1887.2   72.89
 1879.4 
 1757.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1184.6   9.01
 1181.2 
 1198.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  3957.6   53.65
 4004 
 4064.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  100.5   12.23
 123.1 
 103.7 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  437.9   91.09
 332.3 
 513.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  593.6   37.92
 657.7 
 590.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  831.8   106.99
 998.5 
 1031.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  211.6   9.37
 200.1 
 218.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  785.2   35.75
 855.3 
 807.8 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  320.5   7.99
 336.5 
 327.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  64.5   3.09
 59.5 
 58.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  127.3   7.39
 119.1 
 133.9 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  94.7   10.46
 75.9 
 93.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  89.2   2.81
 83.6 
 85.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  91.9   8.84
 83.2 
 74.2 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays