TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g47710
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  426   12.36
 401.4 
 415 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1338.9   39.9
 1402.7  
 1329.2 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  2738.8   136.25
 2468.2 
 2576.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1520.3   97.55
 1328.5 
 1393.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1074.3   34.9
 1138.5 
 1130 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1227.8   21.14
 1250.7 
 1270.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1110.5   100.11
 1178.2 
 1307.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  672.2   42.51
 750.5 
 740.1 
 1.03 Root (ATGE_95)  648.5   49.34
 597.5 
 696.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1281.8   31.08
 1342.1 
 1298.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1469.3   18.94
 1434.7 
 1438.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1705.4   129.28
 1613.7 
 1868.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2019.9   22.88
 2035.6 
 1990.5 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1084.7   11.87
 1068.7 
 1061.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1612.6   79.5
 1683.7 
 1771.3 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  992.4   37.51
 1061.5 
 1052.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  941   35.38
 910.9 
 870.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  1020.6   29.44
 1069.4 
 1016.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  1041   36.96
 967.1 
 1006.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  557.5   28.04
 524.1 
 501.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1688.2   109.49
 1884.2 
 1870.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  2644.2   32.6
 2646.9 
 2701.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  2318.8   90.91
 2355.4 
 2182.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1562.7   40.17
 1623.2 
 1547.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  4431.3   40.17
 4368.1 
 4356.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  3110.3   118.04
 3262.1 
 3029.6 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2787.5   150.14
 2519.9 
 2771.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2018   33.75
 1959.5 
 1959.5 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1803.9   49.25
 1893.3 
 1884.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1667.6   26.6
 1691.3 
 1638.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  3251.1   175.83
 2906.6 
 3017.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  3461.9   96.96
 3336.3 
 3527 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  2251.7   60.43
 2130.8 
 2191.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2777.8   118.15
 2671.8 
 2907.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  3044.2   81.59
 2946.1 
 3108 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  5424.8   340.59
 5576.2 
 6075.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2087.5   25.54
 2059.6 
 2110.6 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  3100.9   2.82
 3100.6 
 3105.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1813.1   124.44
 1821.8 
 2032.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  4204.4   57.57
 4262.4 
 4147.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1385.8   102.04
 1530 
 1332.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  8599.8   419.03
 8870.1 
 8047.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  6773.7   357.88
 6063.4 
 6341.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  5310.4   136.6
 5074.3 
 5073.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  2656.1   85.72
 2535.2 
 2490.4 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2532.4   144.73
 2290.1 
 2274.1 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  103.6   4.07
 103 
 96.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  4970.6   263.19
 4585.7 
 5089.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  4613.4   186.84
 4916.4 
 4575.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2491.9   183.81
 2127.6 
 2266.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  3093.1   75.95
 2946.3 
 3053.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2984   254.75
 3137.7 
 3481.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  3545.3   340.33
 3003.8 
 2917.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1832.8   37.45
 1902 
 1892.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2081   24.72
 2032.4 
 2064.4 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  2110.2   93.7
 2249.6 
 2071.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  2006.7   60.76
 2079.9 
 1959.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1921.1   24.52
 1917.4 
 1876.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays