TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g01420
TIGR annotation:pathogen-responsive alpha-dioxygenase, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  727.5   3.33
 732.5 
 733.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  273   11.53
 293.4  
 292.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  80.2   6.08
 69.1 
 78.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  65.7   5.92
 77.5 
 71.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  61.5   2.48
 64.5 
 66.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  65.5   2.94
 63.1 
 59.7 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  56   3.47
 57.5 
 62.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  3616   87.2
 3617.1 
 3465.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  4386.4   87.24
 4559 
 4494.7 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  66.3   4.19
 72.5 
 64.6 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  147.2   6.22
 150.8 
 138.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  283.4   9.47
 265.5 
 269.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  366.6   10.56
 382.7 
 386.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  76.2   8.21
 63.7 
 79.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  55.3   5.52
 47.1 
 57.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  90.4   5.13
 88.2 
 80.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  5325   214.31
 5465.8 
 5746 
 3.20 Root (ATGE_98)  6315.2   347
 5685.7 
 6253.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  7126.9   80.66
 7255 
 7106 
 3.20 Roots (ATGE_9)  260.5   14.66
 274.4 
 245.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  66.9   1.86
 63.7 
 63.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  89.6   3.45
 85.4 
 92.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  79.5   12.2
 92.8 
 68.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  142.2   4.5
 150 
 142.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  85.3   16.39
 116.9 
 108.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  98.3   14.22
 113.1 
 126.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  92.6   13.06
 84.5 
 110.1 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  74.5   4.53
 82.4 
 82.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  82.5   5.62
 79 
 71.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  75.5   3.92
 71.3 
 67.7 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  265.6   15.26
 235.4 
 246.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  684.3   27.39
 735 
 691.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  44.2   5.15
 54.2 
 51.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  54.8   6.62
 42.6 
 44.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  88.6   7.02
 96 
 82 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  85.6   1.9
 85.5 
 82.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  70.3   1.16
 71.1 
 72.6 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  392.3   14.03
 375.9 
 364.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  60   3.75
 62.8 
 55.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  753.2   14.68
 726.8 
 751.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  100.2   3.75
 107.7 
 103.7 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2207.1   212.23
 2629.7 
 2452.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  653.9   20.66
 622.9 
 614.8 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1394.3   56.62
 1368.3 
 1285.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  44.3   5.02
 52.7 
 53.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  50.1   4.37
 49.3 
 57.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  139.6   18.32
 112.4 
 147.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  80.2   2.94
 86.1 
 83.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  913.2   35.64
 870.5 
 941.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  852.3   34.7
 811.9 
 783.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  51.1   4.92
 60.7 
 57.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  675.4   18.77
 671 
 705.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  795.1   3.03
 790.3 
 796 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  312   24.41
 353.5 
 310.4 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1498.8   36.65
 1487.1 
 1555.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  3511.1   160.12
 3810.2 
 3561.6 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  3262.9   63.39
 3166.8 
 3143.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  3553.5   69.55
 3526.2 
 3421.7 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays