TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g01520
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1318.7   41.74
 1282.2 
 1235.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1372.5   18.45
 1342  
 1375.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1838.8   73.86
 1728.7 
 1698.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  956.1   54.38
 847.6 
 895.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  581.5   16.32
 609.3 
 610.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  593.8   24.02
 626.7 
 640.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  585.5   24
 574.6 
 620.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  2034.5   129.24
 2158.1 
 2292.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  2117.6   24.92
 2122.3 
 2162.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  671.4   47.42
 758.2 
 681.6 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  830.3   13.17
 854.9 
 850.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2166.8   53.51
 2065.2 
 2145.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1725.1   56.39
 1685.2 
 1613.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  665.4   15.9
 673.9 
 643.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  704.3   33.16
 646.6 
 703.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  701.7   36.66
 664.9 
 738.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  1664.2   34.2
 1600.9 
 1610 
 3.20 Root (ATGE_98)  2531.2   108.34
 2601.6 
 2743.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  2130.5   52.11
 2044.4 
 2138.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1753.9   37.56
 1699 
 1682.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1903.5   130.22
 2162.8 
 2012.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  2016.4   123.57
 2039.5 
 2241.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1908.1   53.51
 1806.9 
 1827.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1240.7   13.04
 1260.7 
 1265.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2717.4   138.47
 2760.6 
 2975.9 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2560.7   7.62
 2574 
 2573.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2344.5   166.89
 2136.4 
 2466.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1761.3   23.26
 1796.6 
 1805.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1412.6   65.16
 1528.3 
 1522.3 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1048.2   27.5
 999.5 
 1001.5 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  3149.3   147.64
 2858.4 
 3047.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2696.6   52.28
 2800.3 
 2760.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  629.6   9.17
 625.6 
 643.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  809.4   49.12
 902.2 
 883.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1070   66.72
 945.9 
 1050.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1623.1   62.11
 1641.5 
 1738.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1235.7   26.82
 1229 
 1278.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1369.6   82.1
 1399.7 
 1524.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  800.7   41.58
 812.1 
 877.7 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1419   53.22
 1525.3 
 1476.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1247.3   92.79
 1413.7 
 1259.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1467   51.08
 1568.5 
 1527.4 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  2507.6   105.07
 2493.8 
 2319.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  2512.1   67.48
 2413 
 2541.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  937.2   41.99
 869.5 
 946.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  742.3   23.5
 724.5 
 695.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  678.4   40.11
 725.3 
 758.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  2342.2   62.31
 2466 
 2416.5 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2050.2   123.86
 2176 
 1928.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1144.4   46.59
 1083.5 
 1052.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  4374.1   120.56
 4144.8 
 4324 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1364.1   144.44
 1647 
 1556.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1492.1   35.35
 1493.4 
 1431.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1240.5   16.8
 1243.8 
 1271.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1417.4   28.12
 1382.9 
 1438.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1726.6   80.13
 1882.1 
 1770.8 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1843.1   45.27
 1817.6 
 1755.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1904.4   28.76
 1932.7 
 1961.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays