TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g05880
TIGR annotation:hydrophobic protein (RCI2A) / low temperature and salt responsive protein (LTI6A)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  3094.3   109.63
 2942.8 
 2881.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  4120.9   174.24
 3979.3  
 3774.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  4070.7   226.96
 3777.1 
 3624.1 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  3931.8   266.29
 3452.4 
 3892.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  3229.7   88.29
 3338 
 3404.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  2112.7   76.66
 1982.7 
 2118.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  2717.6   252.65
 2747.5 
 3169.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  5680.4   358.15
 6044.5 
 6396.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  6678.9   86.56
 6686.9 
 6533.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  3243.2   113.42
 3454.2 
 3420.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  4534.2   79.81
 4377.2 
 4480.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  3767.1   188.54
 4099.8 
 4087 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  4582.4   79.72
 4738.3 
 4631.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  3974.4   324.13
 3341 
 3777.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2094.1   25.09
 2139.7 
 2098.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  4240.1   115.76
 4021.1 
 4195.7 
 3.20 Root (ATGE_93)  5341.1   678.25
 5801.6 
 6676.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  9298   383.53
 9007.2 
 8537.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  8779.5   558.34
 8827.5 
 7837.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  2871.5   22.79
 2842.3 
 2826.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  5830.3   598.78
 6882.4 
 6851.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  6133.1   134.43
 6237.3 
 6399.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  5862   163.05
 5545.9 
 5773.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  6027.6   240.21
 6439.6 
 6447.5 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  5329.5   347.98
 5045.4 
 4637.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  6830.3   251.15
 6349.7 
 6716.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  6457.8   456.27
 6299.2 
 5600.2 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  6044.4   116.62
 6107 
 6270.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  5421.3   204.34
 5617.9 
 5209.3 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  5247.1   188.57
 4877.5 
 4997.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  6205   487.53
 7076.9 
 7019.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  6572.6   475.91
 7182.2 
 7510.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  4477   221.93
 4684.3 
 4920.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  5678.4   448.98
 4854.4 
 5575.4 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  6771.2   420.42
 5957.6 
 6548.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  5633.3   346.17
 6127 
 6300.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  4442.5   90.4
 4265.3 
 4322.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  7055.9   155.64
 7314.3 
 7034.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  3258.7   139.72
 3330.9 
 3528.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  4362.1   290.85
 4870.3 
 4371.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  5366.5   181.46
 5029.4 
 5314.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  5707.8   317.23
 5600.5 
 5112.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  5632.6   166.04
 5406.4 
 5309 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  5448.2   354.36
 5759.7 
 6155.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  5464.8   379.41
 4724.7 
 5239.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  4851.9   54.47
 4876.5 
 4772.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  322.7   29.03
 345.7 
 380.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  3084.1   352.78
 2474.5 
 3086.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1411.3   100.66
 1612.6 
 1511.7 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  4284.3   127.74
 4053.7 
 4073.6 
 6.50 Stem (ATGE_27)  10116.6   437.08
 9320.3 
 9406 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2969.9   170.48
 3199.2 
 2866 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2850.8   25.22
 2831.6 
 2881.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2025.6   45.82
 2006.1 
 1938.3 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  3307.8   118.97
 3278.4 
 3497.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  6445.6   137.15
 6222.2 
 6196.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  6140.1   148.27
 6423.1 
 6204.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  6571.5   202.66
 6461.3 
 6854.2 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays