TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g15170
TIGR annotation:cup-shaped cotyledon1 protein / CUC1 protein (CUC1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  51.4   9.65
 58.4 
 70.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  60.5   3.05
 55.2  
 60.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  65.8   8.01
 74.7 
 81.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  59.5   16.66
 92.4 
 71.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  67.4   1.74
 70.3 
 67.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  73.1   4.49
 68.8 
 77.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  75.2   1.1
 76.1 
 77.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  65.3   8.1
 52.3 
 67.1 
 1.03 Root (ATGE_95)  58.8   3.41
 62.1 
 55.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  77.8   6.06
 66.3 
 75.6 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  62   8.07
 55.8 
 71.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  65   2.19
 68.6 
 64.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  52.1   13.87
 78.7 
 58.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  62.3   6.48
 53.7 
 66.4 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  150.4   2.45
 150.6 
 154.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  70.4   4.9
 60.6 
 64.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  67.5   10.15
 54.3 
 74.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  55.1   2.16
 50.9 
 52.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  62   5.74
 53.3 
 51.2 
 3.20 Roots (ATGE_9)  61.3   6.54
 53.1 
 48.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  80.5   15.74
 49.2 
 68 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  66.7   5.54
 77.7 
 71.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  68.5   3.54
 64.8 
 61.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  46.6   11.25
 63.8 
 67.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  53.8   7.08
 68 
 60.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  69.8   10.36
 77.7 
 57.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  62.5   12.67
 61.5 
 83.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  72.4   5.31
 61.9 
 66.4 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  68.3   9.19
 72.7 
 55 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  78.2   4.66
 70.5 
 69.9 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  63.9   9.72
 64.4 
 47.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  60.5   6
 59.5 
 70.4 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  96.9   1.61
 95.2 
 93.7 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  75.5   7.08
 62.5 
 64.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  62.5   3.04
 60.2 
 56.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  50.1   5.14
 46.3 
 56.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  52.3   2.74
 57.5 
 56.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  64.1   9.46
 79 
 61.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  66.2   4.6
 67.8 
 59.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  55.3   4.52
 63.7 
 56.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  59   7.04
 69.2 
 72.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  48.9   5.17
 47 
 56.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  58   0.99
 59.7 
 59.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  55.1   5.43
 49.8 
 60.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  66   5.86
 54.8 
 57.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  78.9   7.64
 64.4 
 75.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  118.4   19.21
 136.4 
 156.8 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  48.1   6.22
 60.4 
 55.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  63   4.12
 57.6 
 54.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  60.3   3.69
 53 
 56.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  57.6   2.39
 55.4 
 52.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  78.8   1.5
 76 
 76.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  92.1   2.29
 90.3 
 87.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  110.9   11.91
 134.7 
 121.7 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  123.2   5.15
 133.4 
 127.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  77.2   7.34
 64.5 
 64.5 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  56.6   10.08
 64.1 
 76.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  46.8   7.44
 48.5 
 60.5 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays