TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g17020
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2874.8   33.44
 2819.1 
 2814.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  3003.6   52.47
 2903.2  
 2926.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  3225.3   94.27
 3061.1 
 3062.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1706.9   82.09
 1552.9 
 1580.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1940   69.81
 2079.6 
 2007.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  2374.4   116.64
 2386.4 
 2582.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1199.1   68.66
 1292.1 
 1333 
 1.03 Root (ATGE_94)  3564.9   178.37
 3678.8 
 3914.6 
 1.03 Root (ATGE_95)  3732.6   199.95
 3581.4 
 3977.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1472.3   62.88
 1580.5 
 1470.9 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1693.1   10.42
 1687.6 
 1672.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  3235.6   120.94
 3039.7 
 3260.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  3521.3   8.62
 3511.2 
 3504.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1689.6   92.99
 1587.4 
 1773 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2391.9   70.94
 2452.9 
 2311.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  1634.1   85.63
 1764.6 
 1603.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  3446.3   102.4
 3241.7 
 3337.2 
 3.20 Root (ATGE_98)  4459.4   143.69
 4196.2 
 4227.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  4330.8   145.29
 4042.5 
 4155.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  3177.1   74.09
 3157.9 
 3040.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  3158   343.48
 3802.2 
 3686.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  3390.3   61.6
 3331.1 
 3267.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  3166.1   74.24
 3069.6 
 3020.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  2861.6   45.24
 2951.6 
 2914.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  4771.4   76.53
 4743.9 
 4888 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  4418.5   33.71
 4463 
 4484.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  3818.7   97.56
 3685.5 
 3875.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2850   124.57
 2938.3 
 3095.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  2672.9   76.97
 2732.5 
 2579.8 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  2364.6   125.68
 2307.5 
 2124 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  3630.5   102.48
 3682.4 
 3828.2 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  4158.4   71.63
 4215.1 
 4300.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  2321.5   83.35
 2221.1 
 2156.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2410.9   218.35
 2066.1 
 2470.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2610.1   47.4
 2520.7 
 2592.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  3398   114.55
 3448.6 
 3616.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2766.3   27.17
 2714.1 
 2726.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  3994.5   121.29
 4113.4 
 3870.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  2119.9   115.95
 2125.6 
 2323.5 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  3116.9   78.54
 3236.5 
 3265 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  2616.3   2.73
 2611.5 
 2611.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  4400.7   460.38
 5139 
 4293.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  4834   436.95
 4497.1 
 3967.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  3753.2   88.45
 3900.5 
 3742 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  3160.4   93.25
 3081.9 
 2974.6 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2164.7   44.79
 2077.4 
 2103.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1491.3   307.52
 924.9 
 1000.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  4585.8   516.53
 3593.1 
 4337.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  3975.2   162.16
 4200.2 
 3885.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2116.9   52.2
 2026.3 
 2026.7 
 6.50 Stem (ATGE_27)  5452.4   300.51
 5004.7 
 5575.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2357.4   158.47
 2658.3 
 2594.1 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2717.5   97.14
 2623.8 
 2523.3 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1861.3   50.91
 1773.2 
 1861.5 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2227.9   28.68
 2179.2 
 2229.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1652.8   117.48
 1706.3 
 1877.7 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1560.3   88.51
 1737.3 
 1651.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1482.3   37.43
 1411.2 
 1426.3 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays