TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g20340
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  350.6   15.62
 323.9 
 323.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  94   6.71
 99.6  
 107.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  58.6   2.12
 62.8 
 60.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  74   0.26
 74.1 
 74.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  62.3   5.1
 70.7 
 71.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  66.2   2.61
 63.7 
 61 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  52   9.05
 68.6 
 66.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  435.2   90.7
 557.3 
 612.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  255.4   6.01
 265.9 
 255.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  64.9   4.88
 74.6 
 69.1 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  76.7   4.01
 69.1 
 70.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  455.4   16.4
 435.1 
 423 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  202   10.92
 180.9 
 196.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  77.3   10.5
 62.5 
 82.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  43.8   7.65
 54.8 
 58.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  84   4.41
 77.1 
 85.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  192.7   18.38
 221.5 
 187.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  680.9   2.85
 684.9 
 679.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  527.6   3.02
 531.6 
 533.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  289.4   14.26
 280.8 
 308.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  59.9   6.63
 73.1 
 65 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  62.3   3.77
 68.2 
 69.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  63.1   7.43
 74.1 
 60 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  72.8   8.76
 85.2 
 89.7 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  63.6   5.73
 65.7 
 74.4 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  70   5.85
 80.4 
 70.6 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  87.8   2.06
 85.7 
 89.8 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  74.6   0.79
 73.1 
 73.7 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  64.3   7.36
 78.6 
 68.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  60.5   1.66
 63.8 
 62.7 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  409.1   23.27
 454 
 421 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  307.5   27.85
 351.6 
 358.9 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  105   3.44
 99.7 
 106.2 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  109.4   7.04
 119.5 
 123 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  93.7   4.28
 100.4 
 101.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  214.7   13.14
 239.4 
 219.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  58.9   3.95
 59.8 
 66.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  223.5   18.97
 214.9 
 251.2 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  57.9   1.75
 54.4 
 56.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  135.4   6.13
 123.6 
 132.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  109.5   6.72
 96.8 
 99.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  395.1   9.08
 405.2 
 413.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  90.5   6.01
 99.8 
 88.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  88.7   0.19
 88.4 
 88.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  49.2   4.65
 58.5 
 54.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  76.9   3.66
 83.9 
 82.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  182.3   13.73
 164.8 
 191.9 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  101.3   5.41
 103.9 
 93.5 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  103.3   4.52
 97.1 
 106 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  93.5   7.23
 79.4 
 83.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  402.9   21.86
 360.4 
 390.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  334.3   6.65
 338.9 
 347.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  290.6   12.68
 313.3 
 311.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  713.2   33.53
 699.3 
 763.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  768.1   10.4
 747.3 
 758.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  766.8   75.53
 899.4 
 770.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  828.8   21.39
 851.4 
 808.7 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  652   35.62
 672.2 
 603 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays