TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g21210
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein / DC1 domain-containing protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS4

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  60.8   3.74
 58.2 
 65.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  65.9   4.97
 70.7  
 75.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  79.1   9.94
 60.7 
 63.5 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  62.7   6.48
 72.1 
 75.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  63.9   1.13
 62.3 
 61.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  71.3   3.81
 63.9 
 69.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  75.9   5.89
 64.6 
 73.2 
 1.03 Root (ATGE_94)  71.5   7.65
 63.6 
 78.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  84.8   3.95
 89.7 
 81.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  70.1   1.21
 72.1 
 70 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  79.7   6.34
 67.1 
 74 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  73.4   6.16
 63.4 
 62.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  72.5   7.56
 59.3 
 72.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  80.1   4.83
 70.7 
 73.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  62.6   2.97
 64.1 
 68.3 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  76.2   8.62
 67.3 
 59 
 3.20 Root (ATGE_93)  66   3.55
 66.4 
 72.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  65.9   1.73
 67.9 
 69.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  71.2   4.97
 72.9 
 63.6 
 3.20 Roots (ATGE_9)  65.2   1.01
 66.9 
 65.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  75.9   7.48
 61.1 
 67.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  64.1   5.6
 55.7 
 53.5 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  63.3   6.31
 51.8 
 62.1 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  77   3.16
 71 
 72.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  64   3.39
 64.5 
 70.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  54.3   8.93
 72.1 
 61.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  68.8   3.43
 75.6 
 72.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  66.1   3.95
 73.5 
 67.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  73.2   4.92
 80.4 
 82.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  80.1   6.39
 68.6 
 79.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  69.7   2.37
 66 
 70.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  61.2   6.96
 68.1 
 54.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  68.4   3.38
 66 
 72.7 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  67.8   3.33
 64 
 70.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  76.4   5.46
 70.2 
 65.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  79   3.79
 75.9 
 71.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  85   8.05
 94.7 
 100.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  67.7   3.49
 67.2 
 73.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  69.2   3.71
 66.7 
 74 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  56.5   8.52
 66.9 
 73.4 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  69.7   8.09
 81.4 
 85.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  62   7.51
 76.6 
 66.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  83.9   3.78
 78.9 
 76.4 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  78.1   4.69
 87.4 
 82.1 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  53.9   7.92
 69 
 65.6 
 6.00 Flower (ATGE_92)  65   1.37
 65 
 62.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  164.4   11.51
 148.2 
 170.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  72.8   3.1
 72.9 
 78.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  67.6   1.94
 71.2 
 68.2 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  73.4   4.15
 70.1 
 65.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  70   3.12
 76.2 
 73.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  55.9   4.74
 65.3 
 60.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  65.2   4.83
 73.9 
 73.2 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  104   8.95
 86.2 
 93.5 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  113.7   15.71
 100.1 
 82.4 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  83.2   15.72
 105.5 
 75.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  129.4   6.08
 121.2 
 117.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  108.6   3.07
 112.2 
 106.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays