TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g25930
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1163.2   48.79
 1068.9 
 1094.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  109.8   5.65
 118.1  
 120.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  100.1   6.94
 94.9 
 108.6 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  96.2   11.97
 119.8 
 104.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  92   10.09
 82.2 
 71.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  87.6   11.28
 85.1 
 105.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  54.8   9.52
 71.1 
 54.3 
 1.03 Root (ATGE_94)  1463.2   83.39
 1449.3 
 1600.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  1524.9   1250.41
 1624 
 3738.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  81   5.09
 90.9 
 83.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  88.2   6.38
 88 
 77.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  85.7   10.86
 70.6 
 91.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  153.3   23.71
 113.9 
 110.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  82.1   14.56
 81.7 
 56.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  73.6   4.74
 64.2 
 68.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  71.9   1.59
 70.8 
 68.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  1082.9   123.69
 1212.8 
 965.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  1767.7   86.58
 1698.7 
 1870.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  1727.8   58.12
 1623.7 
 1630.9 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1048.5   73.87
 938.9 
 1079.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  84.2   9.53
 65.7 
 79.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  93.9   21.71
 87.5 
 127.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  101.2   5.14
 111.1 
 108.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  122.2   8.1
 136.7 
 135.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  94.8   4.01
 97.3 
 89.4 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  84.5   20.93
 116.2 
 76.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  93.4   12.66
 99.3 
 117.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  77.8   1.81
 79.8 
 81.4 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  69.8   16.49
 94.6 
 101 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  105.9   11.24
 86.3 
 105.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  140   11.76
 116.5 
 129.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  154.9   14.93
 125.1 
 138.7 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  62.8   5.26
 58.1 
 68.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  128.6   7.91
 112.8 
 120.3 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  140.8   11.65
 120.1 
 139.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  98   6.9
 109.6 
 97.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  112.2   20.44
 97 
 137.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  168.9   17.28
 202.8 
 191.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  72.1   5.91
 74.3 
 83.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  117   10.04
 127.9 
 107.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  95.6   10.38
 116.3 
 107.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  112.3   12.59
 116.1 
 135.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  138.8   33.29
 154.2 
 90.4 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  181.7   12.87
 198.4 
 207 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  79.3   3.93
 86.7 
 85.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  118.9   3.16
 119.3 
 113.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  228.1   25.25
 200.9 
 251.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  83.2   8.26
 99.8 
 91.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  76.6   16.74
 45.1 
 70.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  110.2   12.33
 91.3 
 114.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  907.6   45.41
 818.2 
 849.2 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  220.2   18.41
 226.7 
 254.8 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  234.9   22.15
 234 
 272.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  364.1   30.83
 337.1 
 398.6 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  377.9   31.32
 358.8 
 316.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  227.8   36.78
 265.3 
 191.7 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  223.2   20.34
 238.8 
 198.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  166.1   16.75
 199.6 
 181.4 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays