TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g26744
TIGR annotation:basix helix-loop-helix (bHLH) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  403.6   3.53
 401.5 
 396.7 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  738.3   15.76
 714  
 743.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  697.8   20.33
 686 
 658.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1117.9   22.87
 1073.7 
 1085.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1995.1   148.24
 2288.9 
 2107.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1909.8   194.6
 1985.5 
 2278.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1335.9   10.85
 1332.3 
 1315.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  352   9.07
 334.4 
 339.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  304.2   10.46
 283.6 
 296.7 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1301.7   13.18
 1275.5 
 1290.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1339.9   13.09
 1316.1 
 1318.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  941.8   14.16
 924.7 
 952.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1184.4   89
 1014.1 
 1054.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1809.8   195.68
 2133.1 
 1780.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1686.5   66.6
 1812.4 
 1787.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  2105.2   65.43
 1995.7 
 2112.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  322.2   6.09
 328.7 
 334.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  315   2.96
 316.5 
 310.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  261.7   16.15
 250.5 
 282.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  382.4   13.9
 354.7 
 370.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  745.9   7.62
 758.1 
 744.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  593.7   41.37
 632.5 
 676.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  623.6   44.28
 697.3 
 618 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1066.9   30.53
 1125.9 
 1082.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  603.5   22.92
 625.1 
 579.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  600.5   13.69
 627.5 
 610 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  662.1   18.26
 652.6 
 687.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  687.7   12.05
 711.3 
 695.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  897.6   38.15
 972.4 
 921.8 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1187.3   10.45
 1207.9 
 1194.7 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  931.1   75.5
 803.7 
 797.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1015.3   73.32
 902.4 
 877.9 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1786.9   135.36
 2047.9 
 1979.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1797.7   31.05
 1787.9 
 1739.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1376.4   26.61
 1345.2 
 1398.1 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  912.7   9.74
 932.2 
 922.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1085   25.82
 1120 
 1135.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  858.7   38.09
 857.4 
 792.1 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1422.6   64.69
 1505.7 
 1550.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  898.3   5.81
 907.2 
 896.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  997.6   20.81
 1039.2 
 1019.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  694.2   6.02
 682.2 
 689.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  690   36.42
 714.9 
 643.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  467.5   30.92
 447.5 
 508.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1532.5   40.83
 1521.4 
 1456.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1723   107.56
 1882 
 1928 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  536.4   8.35
 519.8 
 529 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  817.6   22.66
 818.6 
 778.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  658.9   0.74
 659.1 
 660.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1313.7   40.38
 1242.7 
 1311.6 
 6.50 Stem (ATGE_27)  469.4   7.03
 482.4 
 480.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  4850.2   221.62
 4525.8 
 4949.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  5203.5   195.66
 4867.3 
 4862 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  4318.3   596.78
 4907.1 
 3713.6 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  3627.3   246.96
 4058.6 
 3634.5 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  3500.7   122.46
 3305.5 
 3274.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  3096.1   22.7
 3062.7 
 3052.8 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  3164.8   160.11
 2997.7 
 3317.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays