TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g28220
TIGR annotation:meprin and TRAF homology domain-containing protein / MATH domain-containing protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  91.8   13.56
 78.7 
 105.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  105.8   1.5
 108.3  
 108.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1987   45.54
 1899.1 
 1922.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1435.3   40.81
 1415.1 
 1356.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1052.9   32.39
 1098.6 
 1036 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  302.5   24.34
 274.5 
 323 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1373.8   54.2
 1265.6 
 1314.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  82.5   48.53
 108.8 
 176.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  190.5   9.3
 171.9 
 181.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  885   8.22
 869.7 
 882.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  5338.5   239.11
 5709.3 
 5262.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  558   41.42
 551 
 483 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  394.1   51.56
 484.3 
 395.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  7598.7   429.61
 7604.5 
 6857.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  654.1   22.58
 687.6 
 697.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  7695.5   226.68
 7303.8 
 7697.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  94.4   11.43
 110.6 
 88.6 
 3.20 Root (ATGE_98)  134.7   3
 140.6 
 138.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  176.4   24.66
 127.1 
 150.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  88.7   5.45
 84 
 94.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  486.8   31.44
 433.6 
 489.3 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1235.1   57.98
 1133.2 
 1136.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  725.8   32.88
 677.1 
 739.7 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1543.4   67.17
 1663.4 
 1551.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2974.9   193.68
 3336.8 
 3036.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1142.6   117.88
 1370.1 
 1202.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  758   72.08
 720.7 
 859.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  548.5   44.98
 588.1 
 638.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  497.8   13.41
 487 
 513.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  595.9   38.23
 556.1 
 632.5 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1212   103.75
 1146.1 
 1008.7 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  714.4   12.06
 738 
 730.4 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1965.3   181.27
 2216.5 
 1864.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2735.4   128.74
 2549.6 
 2488.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1803.4   16.38
 1781.4 
 1813.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  960.6   47.51
 908.4 
 1003.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  460.3   30.01
 483.9 
 519.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  961.6   49.62
 931.8 
 1028.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  921.2   40.78
 925.6 
 852.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  465.8   25.93
 489.6 
 517.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  819.5   51.1
 920.5 
 856.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  362.1   28.47
 384.7 
 328.1 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  659.7   25.46
 614 
 656.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  679.9   33.84
 657.3 
 613.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  348.3   16.35
 339.8 
 371.4 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1374.5   33.37
 1413.9 
 1440.8 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  349.5   14.69
 361.4 
 378.7 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  238.1   49.17
 257.5 
 331.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  107.3   3.19
 104 
 100.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  630   43.17
 696.2 
 615.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  106.1   8.8
 122.9 
 119.2 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  130.8   9.9
 130.8 
 113.7 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  188.3   15.08
 160.3 
 164.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  89.4   56.91
 175.1 
 197.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  259.1   37.21
 230.8 
 185.4 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  281.4   34.59
 223.5 
 219.7 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  310.7   52.4
 208.9 
 238.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  246.6   22.18
 246.1 
 207.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays