TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g46960
TIGR annotation:DEAD/DEAH box helicase, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  591   5.75
 601.7 
 592.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  581   11
 574.6  
 596.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  422.2   2.02
 423.8 
 419.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  510.5   8.11
 494.8 
 506.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  598.8   9.47
 593.2 
 611.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  640.1   34.66
 672.8 
 709.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  522.4   12.74
 525.4 
 545.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  516.6   10.69
 498.2 
 516.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  532.5   16.32
 518.6 
 499.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  534   22.13
 489.8 
 509.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  475.1   16.26
 458.3 
 442.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  438.6   21.8
 468.8 
 426.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  494.6   8.88
 505.5 
 512.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  601.9   27.55
 604.7 
 555.6 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  622.7   32.93
 649.3 
 688.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  650   60.78
 578 
 698.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  499.1   19.92
 494.8 
 462.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  552.5   5.53
 562.9 
 554.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  548.1   11.02
 567.8 
 549.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  543   7.24
 528.6 
 534.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  507   51.39
 422 
 414.4 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  383.5   24.95
 384.6 
 427.2 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  374   9.18
 386.6 
 391.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  503.6   7.33
 510.9 
 518.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  423   26.22
 419.3 
 466.4 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  394.1   48.59
 485.3 
 410.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  462   15.21
 467 
 490.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  401.5   16.16
 413.4 
 381.4 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  399   44.68
 468.1 
 482.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  529.2   10.44
 512.1 
 531 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  522   16.11
 497.1 
 527.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  530.1   35.62
 458.9 
 493.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  722.3   14.55
 695.2 
 717.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  673.9   4.35
 682.4 
 676.3 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  675   21.1
 678.7 
 640.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  504.3   16.17
 472.6 
 483.2 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  624.1   24.91
 664.4 
 669.6 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  558.9   11.01
 572.1 
 580.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  694.4   27.79
 656.1 
 710.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  512.4   31.39
 480.2 
 542.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  552.2   17.24
 585.2 
 560.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  399.1   24.81
 446.4 
 435.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  386.5   13.47
 403.8 
 377.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  421.9   2.59
 426.7 
 426 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  690.4   8.86
 683.4 
 701 
 6.00 Flower (ATGE_92)  834.2   74.87
 686.5 
 781.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  503.3   9.55
 502.8 
 486.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  471.9   35.51
 542.3 
 499 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  548.4   14.69
 567.4 
 538.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  633.2   13.14
 613.5 
 608.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  406.5   38.85
 477.2 
 469.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  598.6   17.03
 614.6 
 632.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  707.3   13.81
 692.3 
 719.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  842.3   33.47
 777.1 
 822.6 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  866   71.54
 741.2 
 743.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  534.3   45.06
 559.6 
 472.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  580.3   16.2
 587.2 
 556.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  468.1   28.64
 519.6 
 515.4 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays