TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g47550
TIGR annotation:zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  549   18.93
 512.1 
 523.1 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  532.8   9.91
 521.3  
 541 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  715.6   25.67
 688 
 664.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  405.1   14.3
 428.7 
 402.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  444.2   25.94
 439.7 
 486.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  461   29.98
 509.8 
 515.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  305   12.88
 285 
 280.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  515.8   7.21
 528.2 
 515.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  463.2   42.04
 545.8 
 518.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  323.9   7.61
 339.1 
 330.9 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  485.5   23.21
 507.7 
 531.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  824.9   56.99
 930.7 
 841 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  581.8   7.95
 566.6 
 570.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  474.8   42.47
 527.2 
 443 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  538.5   15.36
 531.5 
 560.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  454.3   31.44
 449.3 
 506.1 
 3.20 Root (ATGE_93)  622.6   31.8
 637.5 
 576.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  495.7   30.24
 552.4 
 542.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  552.2   11.01
 537.3 
 558.7 
 3.20 Roots (ATGE_9)  585.8   27.58
 606.3 
 640.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  678.9   48.25
 582.6 
 624.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  714.3   28.92
 716.7 
 665.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  684.4   24.98
 637.8 
 645.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  592.8   14.75
 593.8 
 567.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  725.9   35.82
 750 
 796.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  765.6   40.67
 845.2 
 820 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  711.8   66.24
 681.7 
 808.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  597.6   8.34
 608.2 
 591.7 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  568.1   16.43
 593.7 
 598.7 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  487.3   23.49
 513.9 
 534.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  877   82.16
 720 
 756.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  798.3   95.81
 659.8 
 614.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  468.1   22.1
 449.3 
 493.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  490.5   17.28
 474.8 
 455.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  560.1   27.39
 537.1 
 591.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  546.6   23.98
 504.6 
 545.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  471.7   7.55
 463.4 
 456.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  616.6   46.39
 600.3 
 687.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  625.9   11.18
 639.6 
 648.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  765.8   37.72
 822.6 
 837.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  416.9   51.64
 510 
 424.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  948.8   16.78
 968.7 
 982.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1225.9   32.32
 1242 
 1288.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  972.7   28.69
 932.9 
 917 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  622.5   17.54
 608.8 
 587.6 
 6.00 Flower (ATGE_92)  544.9   21.41
 553 
 585.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  396.1   18.68
 362 
 365.8 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  763   65.98
 879.4 
 767.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1042.8   14.41
 1019.3 
 1016.7 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  500.6   17.26
 527.3 
 532.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  847.6   69.36
 713.5 
 749.9 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  502.6   26.43
 551.9 
 543.8 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  456.3   30.98
 504.8 
 514 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  551.2   12.92
 567.3 
 576.7 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  727.6   9.38
 744.5 
 743.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  860.5   19.78
 886.2 
 847.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1031.8   26.55
 1081.1 
 1073.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1020.6   16.31
 1052 
 1028.7 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays