TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g53770
TIGR annotation:late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  67.3   2.83
 64.1 
 69.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  52.5   4.01
 44.5  
 49 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  67.9   10.34
 47.3 
 56.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  68.5   7.77
 67.9 
 81.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  53.8   3.35
 50.2 
 56.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  46.6   4.12
 51.7 
 54.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  68.6   4.14
 72.2 
 76.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  56.5   5.92
 46 
 56 
 1.03 Root (ATGE_95)  58.6   2.67
 54.8 
 60 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  70.3   5.42
 65.3 
 59.5 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  69.5   3.85
 61.8 
 65.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  62.7   6.54
 55.9 
 49.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  48   3.42
 54.8 
 51.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  65.8   5.71
 56.9 
 67.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  53.6   3.41
 50.4 
 57.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  63.6   5.48
 61.4 
 53.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  58.6   6.59
 45.5 
 51 
 3.20 Root (ATGE_98)  54.8   2.7
 58.4 
 53.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  63.1   6.89
 52 
 50.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  55.6   0.93
 56.5 
 57.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  49.9   4.7
 40.7 
 47.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  49.7   4.21
 56.5 
 48.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  50.5   3.78
 57.8 
 55.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  61.9   7.5
 74.4 
 75.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  54   6.65
 59.6 
 67.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  44.3   8.31
 59.7 
 57.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  67.9   9.8
 68.8 
 85.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  58.5   3.09
 53.5 
 59.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  49.3   10.15
 69.5 
 57.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  70.5   2.85
 68.4 
 64.9 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  53.9   1.13
 54.3 
 52.2 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  50.7   2.75
 46.2 
 51.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  56   6.34
 49.5 
 43.3 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  57.3   5.51
 48.5 
 58.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  50.8   1.4
 51 
 48.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  54.8   3.85
 51.8 
 59.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  62.4   4.15
 55.1 
 62 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  65.4   5.1
 71 
 75.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  51   2.44
 53.8 
 55.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  58.8   4.56
 50 
 56.4 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  65.1   4.68
 72.8 
 64.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  61.4   3.48
 58.8 
 54.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  60.4   6.24
 70.6 
 59.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  83.4   9.19
 66.2 
 80.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  55.4   5.11
 54.6 
 46.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  41.3   3.1
 40.3 
 46.1 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  178   19.57
 217.2 
 197.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  55.8   7.98
 62.5 
 46.6 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  58.2   2.53
 63 
 61.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  53.8   1.24
 51.8 
 54.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  46.8   3.25
 52.1 
 52.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  47.5   2.21
 48.3 
 51.7 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  60.6   1.47
 57.8 
 58.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  82.7   26.52
 80.1 
 127.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  95.2   2.22
 93.5 
 90.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  144.9   22.64
 102.3 
 136.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  138.9   12.24
 144.2 
 162.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  113.7   29.77
 159.8 
 169.4 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays