TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At3g53990
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2481.9   44.58
 2398.6 
 2467.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1730   30.92
 1668.2  
 1701.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1892.4   37.62
 1817.6 
 1848.6 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1426.5   68.41
 1302.3 
 1314.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  905.7   17.4
 899.8 
 932.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1031   36.74
 1013.7 
 1084.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  479.8   47.69
 491.3 
 567.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  2000.1   122.56
 2098.7 
 2243.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  2323.4   44.04
 2363.2 
 2411.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  903   32.77
 966.5 
 949 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1167.9   31.49
 1227.7 
 1180.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1680.7   137.85
 1420.2 
 1628.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1351.9   32.03
 1405.5 
 1348.4 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  795.6   48.8
 708.7 
 713.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  793.3   24.17
 772.9 
 745.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  763.9   28.67
 740.6 
 797.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  2357.2   167.52
 2401 
 2091.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  2077.1   104.07
 2284.4 
 2164.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  2336.1   122.54
 2141.3 
 2109.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  2480.5   123.51
 2480.2 
 2694.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  2059.5   97.97
 2240.4 
 2215.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1825.1   21.43
 1866.9 
 1854 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1714.8   11.66
 1726 
 1738.1 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  2409.4   112.54
 2317 
 2185.5 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2200.2   48.02
 2271.1 
 2291.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2243.3   115.41
 2428.2 
 2216.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2221.3   181.23
 2084.9 
 2443.9 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1991.4   37.91
 2013.8 
 1939.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1648.9   88.38
 1751 
 1824.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1377.8   24.95
 1349.8 
 1328.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2251.3   83.97
 2098.2 
 2234.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2231.6   19.69
 2255.3 
 2270.7 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  478.3   33.68
 462.2 
 526.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  762.2   54.2
 726.7 
 833.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1233   57.42
 1195.9 
 1308.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2747.8   194.55
 2515.3 
 2901.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1419.6   27.22
 1408.5 
 1367.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  942.7   70.26
 870 
 1010.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1903.8   105.04
 1925.7 
 2095.7 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  2757.4   24.23
 2805.6 
 2786.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1731.6   88.68
 1859.9 
 1689.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2056.6   250.26
 2276.9 
 2556 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  3306.7   217.83
 3187.3 
 2884.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  3280.4   111.33
 3327.4 
 3115.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  3042.8   116.34
 2821.3 
 2870.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  661.1   18.16
 673.1 
 637.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  220.2   34.25
 154.6 
 204.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1521.8   54.25
 1420.4 
 1504.6 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1219.2   58.31
 1330.6 
 1244.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2260.6   96.08
 2177.2 
 2068.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  2778.5   167.75
 2450.7 
 2552.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2062.6   59.56
 1947.4 
 2031.1 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2643.8   172.32
 2547.6 
 2309.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2499.3   120.5
 2533.1 
 2722.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2981.4   12.7
 2956.5 
 2964.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  3472.8   199.12
 3789.6 
 3422.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  3603.8   86.47
 3536 
 3432.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  3290.4   77.61
 3411.1 
 3266.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays