TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g02380
TIGR annotation:late embryogenesis abundant 3 family protein / LEA3 family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  5068.3   107.44
 5173.9 
 5283.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  2736   87.01
 2668.2  
 2840.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  4612.9   229.55
 4172.2 
 4281.1 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  2639.1   187.03
 2265 
 2455.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1328.5   69.85
 1354.6 
 1222.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  553.7   26.3
 602.9 
 594.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  528.5   24.99
 546.9 
 577.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  2672.1   108.15
 2662.9 
 2480.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  3115.6   205.3
 2919.3 
 3329.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  962.6   55.83
 1053.1 
 951.2 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  628.5   3.83
 629.4 
 622.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  9974.9   340.47
 10491.3 
 10617.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  7638.1   173.01
 7982 
 7843 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  523.1   3.41
 516.3 
 520.6 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  121.7   7.36
 119.6 
 133.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  749.6   19.46
 749.4 
 783.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  4294.2   29.55
 4340.1 
 4284.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  4410.3   147.84
 4120.6 
 4316.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  4331.8   88.39
 4328.2 
 4176.9 
 3.20 Roots (ATGE_9)  5227.1   229.36
 5198.8 
 4816.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  3516.5   293.48
 4098.3 
 3874.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  5307.5   391.16
 5942.4 
 6020.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  5427.1   219.95
 5279.2 
 4994.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  2815.4   30.62
 2876.6 
 2847.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  6890.9   194.19
 7240.9 
 7211.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  5573.1   158.78
 5563.2 
 5293.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  5681.2   202.74
 5582.9 
 5972.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  4601.9   79.39
 4604.6 
 4465.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  3962.2   107.91
 3919.3 
 3757.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  2236.6   139.78
 2498.9 
 2284 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  6713.3   819.68
 8020.8 
 8223.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  7290   235.01
 6870.6 
 7264.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  232.8   4.99
 227.7 
 222.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  243.5   6.24
 240.8 
 252.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  3041.8   209.67
 2622.7 
 2818.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  3779.4   211.87
 3945.8 
 4200.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  955.1   28.97
 902.8 
 950.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  9483.4   423.45
 8982.7 
 9824.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  617.1   25.37
 621.3 
 663 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  6418.3   124.12
 6642 
 6437.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1721   109.59
 1932.8 
 1778.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  8394.3   101.95
 8208.5 
 8228.7 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  5892.4   289.12
 5429.5 
 5360.8 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  10701.4   345.84
 10510.5 
 10030.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1992.6   71.47
 1955.5 
 1854.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  520.2   20.14
 479.9 
 499.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  12822.9   934.69
 13315.8 
 14631 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  4506.1   154.42
 4348.1 
 4657 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  6158.5   371.97
 6895.8 
 6441.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  3547.1   127.51
 3318.1 
 3335.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  4147.9   202.33
 3850.3 
 4236.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  937.1   41.29
 873.9 
 859.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1253.1   137.32
 1047.7 
 992.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  270   8.23
 284.2 
 269.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  427.7   3.17
 422.1 
 427.4 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  553.2   32.32
 609.9 
 554.6 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  653.4   14.85
 641.9 
 623.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  472   47.57
 507.4 
 566.2 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays