TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g18780
TIGR annotation:cellulose synthase, catalytic subunit (IRX1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  645.3   15.95
 613.6 
 626.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  885.3   22.66
 854.6  
 841.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  220.6   19.23
 183.8 
 192.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  359.2   33.42
 303.1 
 299.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  278.6   9.43
 297.3 
 285.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  285.1   6.74
 298.5 
 293.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  286.9   9.39
 277.7 
 296.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  617.4   30.45
 563.7 
 565.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  628.7   28.72
 579.3 
 629.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  316.1   22.32
 337.6 
 360.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  211.1   11.63
 192 
 213.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  231.8   18.78
 261.3 
 266.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  294.8   19.46
 260.5 
 261.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  238.7   7.25
 227.6 
 241.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  131.9   21.77
 142 
 173.7 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  219.7   13.25
 218.2 
 241.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  443   15.65
 430.2 
 411.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  662.8   41.76
 581.7 
 605 
 3.20 Root (ATGE_99)  566.4   30.32
 620.5 
 569.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  619.8   21.67
 635 
 592.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  546.9   6.52
 535.5 
 546.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  200.9   12.42
 219.5 
 224.5 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  292.3   11.27
 280.6 
 269.7 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  227.4   10
 228.6 
 245.3 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  204   5.61
 193.3 
 195.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  225.4   28
 169.4 
 197.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  252.7   9.42
 251.1 
 235.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  324.3   5.55
 320.4 
 313.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  359.8   5.45
 369.2 
 369.2 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  389.6   19.13
 361.5 
 398.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  539.1   43.53
 452.8 
 486 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  734.2   23.57
 690.7 
 728.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  183   10.12
 202.8 
 196.2 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  389.4   12.43
 372.6 
 365.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  675.2   57.23
 739.8 
 625.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  387.3   18.19
 416.5 
 383.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  519.5   28.36
 572.1 
 564.3 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  987.8   90.66
 1064.9 
 884.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  178   4.27
 182.2 
 186.5 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  195.1   6.53
 189.9 
 202.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  440   13.89
 413.2 
 432.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  152.2   9.13
 169.6 
 156.3 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  173.8   2.41
 171.2 
 169 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  212   11.73
 191.4 
 191.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  271.6   9.71
 257.3 
 253.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  430.1   6.26
 417.7 
 422.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  234.4   23.07
 201.4 
 189.9 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  247.7   20.46
 218.5 
 257.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  106.1   7.58
 107.7 
 120 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  474.3   10.65
 461 
 482.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  7264.9   244.46
 6779 
 6974.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2364.6   297.08
 2237.4 
 2803.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1523.4   153.2
 1276 
 1243.2 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  172.9   11.88
 154.7 
 177.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  156.2   2.56
 152.1 
 151.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  142.2   0.25
 142.4 
 141.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  143.2   6.52
 147.3 
 156 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  137.1   5.53
 140.3 
 129.5 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays