TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g19690
TIGR annotation:iron-responsive transporter (IRT1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS4

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  914.5   34.64
 846.9 
 867.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  68.3   10.96
 71.4  
 88.7 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  45.6   3.91
 38.8 
 38.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  37.9   4.02
 41.4 
 45.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  37.1   2.33
 38.9 
 34.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  31.7   7.83
 35.9 
 46.9 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  28.2   2.97
 33.5 
 33.1 
 1.03 Root (ATGE_94)  2799.7   213.39
 2374.1 
 2614.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  525   189.03
 862.2 
 545.4 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  33.3   3.06
 32.9 
 38.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  52.4   3.85
 45.9 
 45.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  39   3.9
 46.2 
 40.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  42.6   7.69
 51.1 
 35.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  38.6   3.28
 33.1 
 32.7 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  33.7   2.38
 32.1 
 36.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  35.4   2.92
 31.4 
 37.1 
 3.20 Root (ATGE_93)  1546.5   81.3
 1665.2 
 1509.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  805.4   110.32
 665.8 
 883.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  52.9   4.57
 44.6 
 45.4 
 3.20 Roots (ATGE_9)  514.2   50.15
 575.9 
 613.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  33.1   1.15
 31.4 
 33.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  37.5   5.32
 31.3 
 41.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  30.9   3.62
 34.6 
 38.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  135.8   5.73
 145.9 
 136.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  32   4.86
 34.3 
 41.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  30.7   4.09
 36 
 27.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  41.6   9.34
 33.2 
 51.8 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  29.7   3.44
 35.5 
 35.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  37.5   3.55
 44.5 
 40.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  39.4   2.45
 35.7 
 40.4 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  51.2   6.49
 38.9 
 41.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  46.6   5.41
 42.5 
 53.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  46.9   6.51
 41.4 
 54.3 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  94.9   5.01
 103.2 
 104 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  248   17.77
 212.5 
 229.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  38.9   3.77
 46.3 
 43.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  55   3.24
 49.8 
 55.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1224.8   134.05
 1159.9 
 1417.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  362.2   15.37
 333.1 
 339 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  387.7   5.55
 398.1 
 389.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  29.7   6.45
 42.5 
 37.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  50.2   5.4
 60.3 
 51.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  34.9   4.1
 42.7 
 36.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  141.3   7.13
 155.4 
 150.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  569.7   2.17
 573.5 
 573.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  107.1   3.73
 112.6 
 105.5 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  80.6   11.05
 73.6 
 95.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  29.7   4.49
 37.8 
 30.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  25.5   1.83
 27.5 
 29.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  35.6   2.75
 31.9 
 30.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  31.5   4.55
 37.2 
 40.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  25.7   4.97
 35.4 
 32.5 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  31.5   0.4
 31.8 
 32.3 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  46.2   6.72
 42.8 
 33.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  48.2   6.03
 51.4 
 39.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  44.1   11.69
 61.5 
 39.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  55.5   1.64
 53.6 
 56.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  46.5   10
 62.5 
 65 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays